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基因注释与功能分类
基因注释与功能
的
分类
(3)
答:
一组
基因
直接
注释
的结果是得到大量的
功能
结点。这些功能具有概念上的交叠现象,导致分析结果冗余,不利于进一步的精细分析,所以研究人员希望对得到的功能结点加以过滤和筛选,以便获得更有意义的功能信息。富集分析方法通常是分析一组基因在某个功能结点上是否过出现(over-presentation)。这个原理可以由单个基因...
什么是
基因注释
?
答:
(1)分析mRNA 和EST数据以直接得到结果;(2)通过相似性比对从已知基因和蛋白质序列得到间接证据;(3)基于各种统计模型和算法从头预测。对预测出的基因进行高通量
功能注释
可以借助于以下方法,利用已知
功能基因
的注释信息为新
基因注释
:(1)序列数据库相似性搜索;(2)序列模体搜索;(3)直系同源序列...
基因
组
注释
分析主要包括哪些内容
答:
基因组注释包括以下方面的内容:(1) 重复序列的预测
。通过比对已知的重复序列数据库,找出序列中包含的重复序列,识别类型并转化为N或者X,统计各种类型重复序列的分布。(2) 编码基因的预测。通过将转录组或EST数据比对到拼接后的基因组序列上,找出编码基因位置,预测编码基因结构。或者通过专业的外显...
什么是
基因注释
答:
答:“
基因
”为英语“gene”的音译,是DNA(脱氧核糖核酸)分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列的总称,是具有遗传效应的DNA分子片段,是控制生物性状的基本遗传单位,是生命的密码,记录和传递着遗传信息。所有的基因都由4种碱基组成。地球生物包括动物、植物、微生物,数量巨大,
种类
繁多,形态各异,...
【必备技能】
基因注释
方法合集
答:
首先,了解
基因
ID的多样性是关键。让我们看看几种常见的ID
类型
:Symbol ID,如TP53,是我们在科研文献中常见的基因名称;Entrez ID,如TP53的7157,由NCBI的Entrez gene数据库赋予,通常以纯数字呈现;Ensemble ID,如ENSG00000141510,Ensembl数据库的详尽
注释
让每个基因可能有多个ID,其中ENSG是标志;G、T...
基因注释
方面的问题
答:
定义1: 编码蛋白质或RNA等具有特定
功能
产物的遗传信息的基本单位,是染色体或基因组的一段DNA序列(对以RNA作为遗传信息载体的RNA病毒而言则是RNA序列)。包括编码序列(外显子)、编码区前后对于基因表达具有调控功能的序列和单个编码序列间的间隔序列(内含子)。
基因注释
:大概就是一个基因的资料什么的......
基因
结构
注释
(1):从头注释
答:
基于转录组预测(transcriptome-based prediction):通过物种的RNA-seq数据辅助注释,能够较为准确的确定剪切位点和外显子区域。每一种方法都有自己的优缺点,所以最后需要用EvidenceModeler(EVM)和GLEAN工具进行整合,合并成完整的
基因
结构。基于可靠的基因结构,后续可才是
功能注释
,蛋白功能域注释,基因本体论...
什么是
基因注释
annotation
答:
基因组测序只能测出整个DNA的碱基对排列 顺序,不能直接测出DNA上的基因及其
功能
,必须通过生物信息学方法,结合蛋白组学、 转录组学,对测出来的序列进行分析,将基因 及其功能加以挖掘、注释,这称作
基因注释
。
什么是
基因
结构
注释
答:
属于生物信息学范围名词,即以
基因
的结构作为客观依据,通常通过对其结构的改变观察相关基因的
功能
、性质的变化,来对于此基因结构所对应的功能予以联系。简而言之,便是通过研究基因的结构与其功能的关系,以求得通过观察基因结构便能预推出其功能的研究方法与思路。近来的研究表明,基因组不仅是基因的简单排列...
基因功能注释
是什么意思
答:
基因
的解释[gene] 存在于细胞的染色体上的生物体遗传的基本单位 详细解释 (1).起因;基本 原因 。 郁达夫 《杨梅烧酒》 :“而这一出实在 也是 滑稽 得很的小悲剧,现在却 终于 成了我们两个旧友的再见的基因。” 郭沫若 《羽书集·驳<实庵字说>》 :“我的其它的 不同 性质 的 著作 ,都...
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