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氨基酸序列比对输出图
如何利用DNAMAN进行多
序列比对
的同时
比对氨基酸
(如图)
答:
1、首先在电脑中打开DNAMAN软件,然后点击File,New,建立新的对话框。2、在新的对话框中输入需要翻译的碱基
序列
(可复制粘贴),并同时按住键盘的Ctrl和A将输入的序列选中,如图显示黑色。3、单击如图所示Seq,如果出现如图对话框,选择是或否时,单击“是”。如果没有出现可忽略此步。4、之后单击如图...
中心法则3——Protein(蛋白质)
答:
第一步是转录,遗传信息由DNA经转录转移到mRNA中,第二步是翻译,根据遗传密码的中心法则,将成熟的mRNA分子中“碱基的排列顺序”(核苷酸序列)解码并生成对应的特定
氨基酸序列
。翻译的具体过程为:mRNA被分成三个连续字母的单位,每个字母被称为密码子(codon),然后将密码子通过翻译表翻译成氨基酸,因此...
SIFT :一个预测
氨基酸
替代是否影响蛋白功能的工具
答:
氨基酸
替代是否有害的阈值是0.05。氨基酸颜色说明:黑色表示非极性氨基酸,绿色表示极性不带电荷的氨基酸,红色表示碱性氨基酸,蓝色表示酸性氨基酸。大写字母表示氨基酸出现在
比对
中,小写字母来自预测。“Seq Rep”是包括碱性氨基酸的
序列
片段,短片段表示这个位置要么有很多空位,要么因为信息少而不能比对...
质谱图怎么看
氨基酸序列
数据
答:
1、确认分析使用的肽段或蛋白质,注意查看其
氨基酸序列
,并了解每个氨基酸的分子量。2、找到质谱图中对应的峰或信号,注意其所对应的分子量,和其相对强度或丰度。3、将质谱图上的分子量与氨基酸序列进行
比对
,确定对应的氨基酸残基。一般而言,质谱图上的峰或信号所对应的分子量减去前一个峰或信号所对应...
关于使用blaste进行
比对
的结果分析
答:
前面的数字表明是第几个
氨基酸
。+号表示性质相似的氨基酸。———Identities是完全一样的氨基酸,而Positives则是性质相似的氨基酸比例。下面的那三条序列,Query是数据库里的序列,sbjct是你提交的序列,中间的是两条
序列比对
的结果。懂么?
MEGA:安装与
序列比对
Align
答:
一、下载安装 选择下载版本,下载压缩包并安装(MEGA11)二、Align模式介绍 1.上传数据进行ALIGN 准备数据:核苷酸序列或
氨基酸序列
,获取途径:NCBI等 以NCBI中随机下载的10条核苷酸序列为例:ncbi.fasta 点击:File -> Open A File (选择ncbi.fasta) -> 点击Align 2.Alignment界面介绍:3.
序列比对
-...
Clustal x软件进行
序列比对
,怎样找出
氨基酸序列
无间隙保守区段...
答:
Clustal x软件进行
序列比对
,怎样找出
氨基酸序列
无间隙保守区段???想借助此来辅助设计兼并引物。。。 对比出来的结果看不懂???... 对比出来的结果看不懂??? 展开 我来答 分享 微信扫一扫 网络繁忙请稍后重试 新浪微博 QQ空间 举报 浏览15 次 可选中1个或多个下面的关键词,搜索相关资料。也可直接点...
分子进化笔记(四): MEGA5构建系统发育树
答:
氨基酸序列
:>sequence2_name MQSPINSFKKALAEGRTQIGF 2.多
序列比对
打开MEGA5,点击Align,选择Edit/BuildAlignment,选择Createa new alignment,点击OK。要选择序列类型,核酸(DNA)或氨基酸(Protein)。选择之后,在弹出的窗口中直接Ctrl + V粘贴序列(如果所有序列在同一个文件中,即可全选序列,复制...
使用mafft进行多
序列比对
答:
多
序列比对
(多序列联配,Multiple sequence alignment, MSA) 是指把多条(3 条或以上)有系统进化关系的蛋白质分子的
氨基酸序列
或核酸序列进行比对,尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一列上。这样做的意义是,对齐的碱基或氨基酸残基在进化上是同源的,即来自共同祖先(common ancestor)。多序列...
如何使用SnapGene将DNA序列转换为
氨基酸序列
答:
在
序列比对
的过程中,常常需要将核苷酸序列转换为
氨基酸序列
,
比对氨基酸
是否有所突变。方法有很多,我常用的一种是通过SnapGene软件转换。操作如下:1.需要准备一条目的基因序列(fasta格式),通过SnapGene软件打开。点击Map选项卡,选中CDS的区域(如果这个文件为cds序列,则全部选中;若cds是片段,则选中cds...
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