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用来预测蛋白质亚细胞定位的是
targetp
的参数orgpl代表
答:
-targetp参数中的orgpl指的是待预测蛋白质序列的亚细胞定位
。它是一个可选参数,用于帮助预测器更准确地预测蛋白质的亚细胞定位。orgpl参数可以选择的值包括:
cyto(细胞质)、nucleus(细胞核)
、mito(线粒体)、chloro(叶绿体)、secreted(被分泌的)、other(其他)等。如果不输入该参数,则预测器...
亚细胞定位
用gfp号还是yfp好
答:
GFP就是绿色荧光蛋白
,YFP就是Thr203以Tyr取代,发出黄色的荧光,成为黄色荧光蛋白 因此两者最大的区别则是发射波长了 亚细胞定位用YFP或者GFP都是可以的 需要考虑:如果是标记在N端很可能影响定位 如果是红色的探针,选用绿色GFP比较经典,两者叠合的橙色也是很多文献上常采用的。但如果是蓝色的探针,则选...
targetp
结果分析怎么看
答:
预测分类等。
1、TargetP的主要目标是预测蛋白质的亚细胞定位
,结果给出蛋白质的分类。2、TargetP还为每个预测结果提供了得分,较高的得分表示预测结果的可靠性较高。
求助:如何分析
蛋白质的亚细胞定位
答:
预测蛋白质的亚细胞定位,
是通过生物信息学的方法的
。或者你在NCBI数据库中比对到了编码类似蛋白的基因,如果该基因有人做过亚细胞定位的实验,你也可以大概知道其编码的蛋白质在细胞内部的定位。不同物种,不同基因家族成员有可能有区别。最终还是需要实验来验证的。功能基因研究中,经常会进行基因编码的蛋...
蛋白质
序列分析路线图和工具都是什么?
答:
(3) 亚细胞定位预测。
推荐使用PSORT软件对PDCD5蛋白的细胞内定位进行预测
。PSORT将动物蛋白质定位于10个细胞器:(1)细胞浆,(2)细胞骨架,(3)内质网,(4)胞外,(5)高尔基体,(6)溶酶体,(7)线粒体,(8)胞核,(9)过氧化物酶体(peroxisome)和(10)细胞膜。蛋白质是组成人体一切细胞、组织的...
如何分析
蛋白质的亚细胞定位
答:
预测蛋白质
的亚细胞定位,是通过生物信息学的方法的。或者你在NCBI数据库中比对到了编码类似蛋白的基因,如果该基因有人做过
亚细胞定位的
实验,你也可以大概知道其编码的蛋白质在细胞内部的定位。不同物种,不同基因家族成员有可能有区别。最终还是需要实验来验证的。功能基因研究中,经常会进行基因编码的...
关于gfp融合
蛋白的亚细胞定位
求助
答:
预测蛋白质
的亚细胞定位,是通过生物信息学的方法的。或者你在NCBI数据库中比对到了编码类似蛋白的基因,如果该基因有人做过
亚细胞定位的
实验,你也可以大概知道其编码的蛋白质在细胞内部的定位。不同物种,不同基因家族成员有可能有区别。最终还是需要实验来验证的。功能基因研究中,经常会进行基因编码的...
DFP
亚细胞定位
主要用作什么方面?可以打个比方么?
答:
难道又推出新的荧光
蛋白
了?目前主要用作
亚细胞定位的是
GFP绿色萤光蛋白,就是因为这个今年3个哥们得了诺贝尔化学奖。亚细胞定位就是看目的基因的表达产物被定为在细胞的哪个位置,比如细胞核或细胞质。操作上一种方法是在你要表达的基因上加上高效启动子和一段GFP序列,用基因枪将你整合的序列打入一些...
protcomp
蛋白质亚细胞定位
结果怎么看
答:
protcomp
蛋白质亚细胞定位
在核内、胞质内或者细胞膜上看。在核内、胞质内或者细胞膜上存在。GFP是绿色荧光蛋白,在扫描共聚焦显微镜的激光照射下会发出绿色荧光,从而可以精确地
定位蛋白
质的位置。
【小远答疑】
亚细胞定位
常见问题
答:
定位之旅:荧光
蛋白
的导航技术 荧光蛋白,如GFP和RFP,是
亚细胞定位的
得力助手。它们犹如夜空中的北极星,通过与目标蛋白的结合,引导我们追踪它们在细胞内的足迹。通过融合在蛋白的N端或C端,我们能够观察到荧光蛋白与之共定位的细胞器,从而揭示出目标蛋白的精确位置。常见疑问与解答 1. 融合位置的秘密:...
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蛋白质对接工具最简单三个键
蛋白质结构模型质量评估软件
用来预测蛋白质序列的信号肽的是
蛋白质亚细胞定位的预测工具有
人类基因组的长度约为
蛋白质结构比对的意义
下列不属于蛋白质对接工具的是
蛋白质三维结构数据库主要有
蛋白质二级序列数据库是