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go分析怎么看注释基因
【
基因
组——天麻】天麻基因组揭露植物适应异养
答:
天麻不进行光合作用,富集“叶绿体”,“质体“
注释
的
基因
在基因组中具有代表性的丢失 天麻线粒体有430个基因家族,1532个基因。
GO分析
表明这些基因参与一些代谢过程。探究天麻基因组中扩张的基因家族对与真菌微生物关联的影响,发现单子叶甘露聚糖结合凝集素抗真菌蛋白家族(GAFP)在天麻基因组中包含20个基因...
基因
集富集
分析
(GSEA)简介
答:
探索
基因
表达的秘密武器:GSEA详解 在科研领域,传统的KEGG/
GO分析
虽广泛使用,但对于上调和下调基因的精细区分却略显不足。这时,基因集富集分析(GSEA)应运而生,它以独特的视角比较基因集而非单个基因,捕捉表达趋势的全局变化,通过Enrichment Score评估通路的整体表现力。GSEA的三大核心特点:一是关注...
你好,我想找一个
基因
序列进行
分析
,我该去哪找?
答:
然后随便输一个你想查询的
基因
,比如我输GFP,然后从搜索列表里选出你想要的条目,会弹出它的详细资料,里面在genomic regions, transcripts,produces里面有一个
go
to nucleotide,选一个格式(一般是FASTA),恩,然后你就拿到这个序列了。另外我真不
知道
你准备
怎么分析
,如果需要的话欢迎追问~...
go分析
中大鼠的背景
基因
有多少个
答:
在生物实验室的
go分析
中,大鼠的背景
基因
共有25组一共163个基因。
如何
进行转录组数据
分析
?
答:
然后回来你可能要校正错误序列,软件SEECER。这时候你的fastq文件就变成fasta了。然后你拼接序列啊,用Triity,拼好后可以进行blast比对,看有没有匹配。还可以用blast输出的文件做blast2
go
,得到
GO
号,做GO的
注释
,KEGG pathway
分析
。还有进行差异表达
基因
的分析分等等,我现在说的是没有参考基因的转录组...
单细胞转录组基础
分析
七:差异
基因
富集分析
答:
此前的
分析
我们按转录特征把细胞分成了很多类别,例如seurat聚类分析得到的按cluster分类,singleR分析得到的按细胞类型分类,monocle分析得到的按拟时状态(state)分类。不同的细胞类型之间,有哪些表达差异基因呢,这些差异基因有特别的意义吗?基因差异表达分析 差异
基因GO
富集分析 差异基因kegg富集分析 ...
转录组数据
分析
RNA-seq
答:
或TPM(每百万转录本的片段数)等标准化指标,以消除
基因
长度和测序深度的影响。4.差异表达
分析
:使用统计模型比较不同条件或组别之间的基因表达水平,确定差异表达基因。5.生物学功能解释:对差异表达基因进行富集分析,包括基因本体(
GO
)分析和通路分析(如KEGG),以揭示这些基因在生物学上的作用。
基因
本体(gene ontology,
GO
)
答:
【答案】:
GO
数据库是GO组织构建的一个结构化的标准生物模型,旨在建立基因及其产物知识的标准词汇体系,目前已经成为应用最广泛的
基因注释
体系之一。
读文献先读图---气泡图
答:
医学研究中的应用实战 在
基因
研究中,气泡图更是大显身手。面对海量基因数据,它能以一张图展现多个变量,如在基因功能富集
分析
中,科学家们利用它标记基因特点和功能,通过KEGG和
GO
数据库推断未知基因的功能。这就像侦探推理,用已知信息推测未知,但结论还需通过实验证实,就像寻找亲缘关系一样,理论与...
如何
从众多
go
生物学
分析
中选取出需要的生物过程
答:
1 如果肯下功夫,可以通过R语言获得
基因
本体论以及通路富集数据并将其可视化,所用的R包可以是GOSim(
GO分析
),或者clusterprofiler(GO&KEGG)2 cytoscape 的插件cluego可以傻瓜式实现通路的图片展示,可以用来直接发文章(低分的至少可以)3 关于GO和KEGG数据的获得,上DAVID就好 ...
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