中国水土保持学会自1985年3月经国家体改委和中国科学技术协会批准成立以来，见证了中国水土保持事业的不断发展。1986年5月，学会在北京召开了第一次全国会员代表大会，杨振怀部长担任了第一届理事会的理事长，这一角色在1992年的第二次全国会员代表大会上得以延续。2006年，鄂竟平副部长接任第三届理事会理事长，理事会成员包括140名理事，其中有台湾省代表一名，常务理事19名，副理事长5名，秘书长1名，副秘书长6名。
学会的办事机构包括秘书处、办公室、学术部、科普部、组织联络部、国际部和咨询部，其中办公室有5名专职工作人员。中国水土保持学会拥有12个专业委员会，涵盖了水土保持的各个领域，如防护林、预防监督、小流域综合治理等。15个省（市、区）也成立了省水土保持学会，加强了地方与国家级学会的协作。
截至2009年，学会会员总数超过9800人，包括22个团体会员单位，如水利部黄河水利委员会、中国恩菲工程技术有限公司等，外籍和台湾名誉会员也有所贡献。学会的官方出版物包括《中国水土保持科学》双月刊和《中国水土保持学会会讯》一年四期。值得一提的是，一些知名的水利机构如黄河水利委员会、长江水利委员会等都是学会的重要团体会员，他们的法人代表如陈雄龙、张兆祥等，均持有会员证。
中国水土保持学会位于中国北京海淀区清华东路35号，是由全国水土保持工作者自愿组成，并依法登记的全国性、学术性、科普性的非营利性社会团体，是中国科学技术协会的组成部分。学会成立以来，先后接待过来自美国、英国、法国、德国、尼泊尔、日本、俄罗斯、朝鲜、泰国等多个国家的学术团体及专家的来访，组织召开专业性的国际学术交流会议。普及和推广水土保持科学技术，为广大水土保持工作者服务。中国水土保持学会致力于加强海峡两岸水土保持领域的交流与合作，与中国台湾相关的民间组织及专家学者有着密切的协作关系。