（一）概念不同：
1.事业单位在编：凡是通过事业编制考试（笔试和面试）即可成为事业单位在编人员，就是已经纳入了该单位的人事编制，就是正式员工。
2.事业单位不在编：事业单位不在编就是本单位自行外聘的人员，就象企业聘用一样，由单位自行规定其待遇，付给其工资，与地方财政没有关系。
（二）福利不同：
1.事业单位在编：有编制的话你的待遇是有保证的，事业单位在编员工完全享受用机构的福利政策（包括节日慰问、年货、旅游等）。
2.事业单位不在编：事业单位不在编人员的绩效工资，住房公积金，住房公积金补贴等比在编人员差一点，只能享受事业单位的部分福利。
（三）晋升途径不同：
1.事业单位在编：有编制的话属于正式员工，根据工龄、能力（社会背景）可以考职称，也可以有其它升职的途径。
2.事业单位不在编：没有编制的话你干几年都是普通科员，原则上不在事业单位晋升范围内。
（四）合同不同：
1.事业单位在编：在编的员工很多都是长期合同或无固定期限合同，由用人机构直接签署。
2.事业单位不在编：不在编的员工合同多为派遣公司代理，也就是所谓的劳务输出，就算是用人机构签订合同，也是短期合同。
（五）在单位地位不同：
1.事业单位在编：有编制的员工有投票权，在竞争上岗、年终互评的时候能发表下意见，日常工作量也不会太大。
2.事业单位不在编：没有编制的话或许就没有投票权，因为你不做有随时走人的风险，所以没有编制的人员往往要承担较大的工作量。
扩展资料：
编制分类：
参照公务员法管理事业单位
使用事业编制，但须参加公务员考试;如设区市的城管
全额拨款事业单位
又叫全额财政拨款事业编制，多为一些公益性事业单位，如图书馆、文化馆、博物馆、学校等。
差额拨款事业单位
由财政进行差额拨款，待遇和收入在一定程度上挂钩，如医院和部分景点等。
自收自支事业单位
实际上与企业差不多，待遇和经营状况息息相关，多为一些服务型事业单位，如设计院等。
管理岗位：
管理岗位的最高等级和结构比例根据事业单位的规格、规模、隶属关系，按照干部人事管理有关规定和权限确定。
事业单位现行的部级正职、部级副职、厅级正职、厅级副职、处级正职、处级副职、科级正职、科级副职、科员、办事员依次分别对应管理岗位一到十级职员岗位。
根据事业单位的规格、规模和隶属关系，按照干部人事管理权限设置事业单位各等级管理岗位的职员数量。
事业编辑岗位类别：
（1）主要以专业技术提供社会公益服务的事业单位，应保证专业技术岗位占主体，一般不低于单位岗位总量的70%。
（2）主要承担社会事务管理职责的事业单位，应保证管理岗位占主体，一般应占单位岗位总量的一半以上。
（3）主要承担技能操作维护、服务保障等职责的事业单位，应保证工勤技能岗位占主体，一般应占单位岗位总量的一半以上。
（4）事业单位主体岗位之外的其他两类岗位，应该保持相对合理的结构比例。
（5）鼓励事业单位后勤服务社会化，逐步扩大社会化服务的覆盖面。已经实现社会化服务的一般性劳务工作，不再设置相应的工勤技能岗位。
事业编制各类岗位：
事业单位管理岗位、专业技术岗位和工勤技能岗位的基本条件，主要根据岗位的职责任务和任职条件确定。事业单位三类岗位的基本任职条件：
（1）遵守宪法和法律；
（2）具有良好的品行；
（3）岗位所需的专业、能力或技能条件；
（4）适应岗位要求的身体条件。
参考资料来源：