和田玉的黑点，通常是一种天然的瑕疵，新疆和田的青花料（山料，籽料）都是因为有黑点而得名，新疆和田碧玉（山料，籽料）里边也会有不同程度的黑色斑点或斑纹，这是新疆和田碧玉的标志之一。
硬度是鉴定和田玉的重要标志之一，是指矿物抵抗外来机械作用力（如刻画、压入、研磨等）侵入的能力，在宝玉石学中通常所用的摩氏硬度就是指其中的刻划硬度。
珠宝业中一般把硬度作为划分宝石和玉石的一个重要标志。宝石硬度一般在摩氏7度以上，玉石硬度一般在摩氏4—7度，摩氏4度以下通常称为彩石或雕刻石。硬度大，抛光性好，能使玉器发亮，同时也便于长期保存。
透明度是玉石允许可见光透过的程度，主要与玉石对光的吸收强弱有关，矿物学上一般分为透明、半透明、不透明3种。
鉴定透明度要把玉磨光，在一定厚度下看透视其它物体情况，分透明体、半透明体、微透明体、非透明体等4个级别。和田玉属于微透明体，在一般进取度下，能透过光，但看不清透过物像。
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