缺乏足够的资金支持，基础设施缺乏，处理简单、随意，环境污染严重。村民往往按照就近原则处理，将垃圾随意倒在沟边、河边、塘边、路边等空旷地段，致使垃圾成堆，村里也没有相应的机构去处理垃圾，去维护环境。长期暴露的垃圾堆容易滋生蚊蝇、老鼠等，成为各种疾病的传染源，规模庞大的农村垃圾不仅占用大量土地，其中一些有害物质还极易破坏地表植被，影响农作物生长，造成土壤、河流环境污染，随意焚烧垃圾使得空气污染严重，影响着农村的发展和村民的身体健康。
生活垃圾组成以有机物成分（厨余、果皮等）为主，玻璃、塑料、金属等可回收物质的比例相对不大，并且随着农村的发展和建设，垃圾组成会向城市垃圾成分变化，无机含量，尤其是灰渣含量大幅降低，而易堆腐垃圾和可回收废品含量则持续增长。当前农村生活垃圾处理方式以填埋为主，垃圾的收集方式为混合收集，一些有害物质如干电池、废油等未经分类直接进入垃圾，增加了无害化处理难度。另外，一些可回收资源利用物质也是直接填埋，这造成了资源的浪费，也使得垃圾成分在处理时更加复杂化。农村生活垃圾收集和运输已无法满足当前新农村建设的需要。农村垃圾一般由村内自行收集，大部分村子以敞开式垃圾池收集为主并配一定数量的垃圾桶。
各村不同程度地存在垃圾池的设置数量少，服务半径不合理，垃圾桶缺失或损坏严重，垃圾收集车数量少，效率低的现象，特别是有些村子，由于资金等诸多原因造成应建的收运设施及配套设备被搁浅等。像有些村子，村内不具备垃圾收集设施，村内垃圾全部堆放在村子周围的道路边和河道内。我国农村垃圾的处理主要采取单纯填埋、临时堆放焚烧、随意倾倒三种处理方式。农村采用的单纯填埋一般是利用现有的沙坑或者低洼地直接进行倾倒垃圾。随着时间的推移，混合垃圾腐烂、发臭以及发酵甚至发生反应，不仅会释放出危害人体健康的气体，而且垃圾的渗滤液还会污染水体和土壤，进而影响农产品的品质。
许多地方处理模式粗放，收运处理过程污染严重，一般有3种模式：没有垃圾收运处理设施，垃圾随处乱堆，甚至直接倾倒在河道;设有简易垃圾收集点，但没有密封、清洁措施，最终采取简易堆放;收集点转运至简易垃圾填埋场，收运成本高，资源浪费。如此种种的形成原因是投入不足，环卫设施基础薄弱。一些地方经费匮乏，未纳入地方财政预算导致如下问题：收运设施缺乏或简陋;以人力作业为主，劳动强度大，工作效率低，收运不及时;处理以简易填埋为主;大量堆场污染环境亟待修复。
