在"十二五"期间，全国城镇污水处理及再生利用设施的建设将投入大量资金，预计总投资额达到4300亿元人民币。这一投资主要分为两部分，一是设施建设投资，总计4271亿元，包括对现有管网的完善和新建，总计2443亿元；新增城镇污水处理能力的投资为1040亿元；污水处理厂的升级改造投资为137亿元；污泥处理和处置设施的投资为347亿元；再生水利用设施建设的投资则为304亿元。
资金来源上，城镇生活污水处理设施的建设资金主要由地方政府负责，要求各级政府切实增加投入，确保完成规划中的各项任务。同时，鼓励产业化的推进，根据各地实际情况制定相应的政策措施，吸引社会资本参与，实现投资主体和融资渠道的多元化。政府贷款，包括银行贷款、外国政府或金融组织的优惠贷款和赠款，都是资金筹措的重要途径。
国家层面，会根据规划任务和建设重点，继续给予资金上的引导和支持，对各类设施建设给予适当扶持，共同推动城镇污水处理及再生利用设施的建设进程。
为加快建设全国城镇污水处理及再生利用设施，提升基本环境公共服务水平、促进主要污染物减排、改善水环境质量，2012年4月19日，国务院办公厅以国办发〔2012〕24号印发《“十二五”全国城镇污水处理及再生利用设施建设规划》。该《规划》分指导思想、基本原则与主要目标，主要任务，投资估算及资金筹措，保障措施，规划实施5部分。《规划》提出的主要任务是：加大城镇污水配套管网建设力度，全面提升污水处理能力，加快污水处理厂升级改造，加强污泥处理处置设施建设，积极推动再生水利用，强化设施运营监管能力。
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