公立大学校长的任命是按照大学的行政级别，由不同级别的政府机关任命。而我国的公立高校的行政级别一般分为三级：副厅级、正厅级、副部级。副厅级高校一般是专科类高校，正厅级高校则为本科类高校，而副部级高校则是本科高校中实力比较强的几所高校。
其中副厅级、正厅级的大学校长，一般按照大学的主管部门不同分别由省政府或教育部任命。除了副厅级、正厅级大学外，副部级大学校长的任命，则由中共中央任命。
扩展资料：
北京大学、清华大学、浙江大学、复旦大学等是副部级，这些大学校长对应的行政级别也都是副部级，与每个省的副省长级别相当。
根据统计，全国42所“双一流”高校中，除了中国海洋大学、东北大学、电子科技大学、中央民族大学、华南理工大学、湖南大学、华东师范大学、郑州大学、云南大学、新疆大学这十所大学为正厅级外，其余32所“双一流”高校均为副部级编制。（国防科技大学为正军级，对应地方行政级别为副部级）
参考资料来源：