三本毕业证书和二本没有什么区别。
第三批本科(the third batch of undergraduate)简称“三本”,是指中国大陆高等教育本科层次录取批次和录取顺序排在第三批次。三本院校的招生是根据参加全国统一高考录取的方式进行的。 一本、二本、三本都属于“普通高等学校”教育系列,学制为四年,毕业证书和学位证书都是“普通高等学校”教育证书。
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三本院校包括:
1、独立学院==独立二级学院(公、民合办,民企出资,属于民办范畴)。
2、民办普通本科高校。(私办、私人出资)。
3、合作办学本科高校。(属于民办范畴)。
以上内容参考百度百科——三本