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2019-03-01 序列下载及合并,多序列比对,进化树
如题所述
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第1个回答 2022-07-21
参考学习网址:
https://blog.csdn.net/u011262253/article/details/78506951
OR 对齐完之后,选择两端不齐的部分,右键delete即可。
导出fasta格式和MEGA格式两种格式
打开Clustalx 加载刚刚比对完的fasta格式(注意是比对完的,文件后缀名为.fas)
导出可视化文件,参数默认点OK
!得到可视化的多序列比对结果,打开类似这样(打开用到的软件为Adobe Acrobat)
https://www.sohu.com/a/164261454_652735
MEGA7软件
第一步open,retrive file,species.fasta文件; 比对后选择保存,处保存为mega format,文件名为species.meg
第二部 data,open,打开species.meg,建树后保存,file,export成Newick格式,文件名为 species.nwk
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