广昌县卫生局作为广昌县人民政府的卫生工作主管机构，其主要职能包括：
执行国家和上级政府关于卫生工作的方针、政策、法律和标准，制定全县卫生事业的长远规划和年度计划，提出卫生改革和工作的具体建议，并负责监督实施。
研究并协调全县的卫生资源配置，制定社区卫生服务的发展规划和服务标准，指导其实施，以优化公共卫生服务体系。
关注农村和妇幼卫生，制定相关政策，指导初级卫生保健和母婴保健技术的推行，提高妇女和儿童的健康水平，提升人口素质，防治严重威胁其健康的疾病。
坚持以预防为主的策略，推动全民健康教育，制定疾病防治计划，特别是针对重大疾病的综合防治，以及全县计划免疫工作的规划。
确保《执业医师法》和《医疗机构管理条例》的执行，监管医疗机构，制定医疗人员执业规范、医疗质量和服务标准，监督实施，并参与医疗机构的改革指导。
负责采供血和临床用血的监管，保证医疗安全。
参与医学科技和教育规划，组织科研攻关，推动科技成果的普及应用，管理继续医学教育和成人医学教育。
确保《传染病防治法》、《食品卫生法》等法律法规的实施，监管公共卫生，包括传染病防治、食品安全、职业健康、环境和学校卫生等，实施卫生监督和职业卫生监察。
在突发公共卫生事件中，制定应急处理政策，协调应急响应工作。
弘扬中西医并重，推动全县中医药事业发展，指导中医医疗、教学和科研工作。
制定卫生人才发展规划，倡导卫生人员的职业道德，促进医疗机构的精神文明建设，并参与卫生机构编制和人员资格认定工作。
作为县爱国卫生运动委员会的日常工作部门，负责相关工作的执行。
完成政府交付的其他相关任务。