校址原来在涵江区 古驿前边 鳌峰田宅 ，后搬迁至兴化府节孝祠内---莆田兴化府城隍庙--莆田学院附属医院 市区院区 附近内。同年10月，增设初中部，改称私立莆田中学(俗称公学)，小学部称莆田公学附属小学，校址迁到四贤祠(今中山中学西边一部分)内上课。 民国20年，西元1931年，改名莆田私立初级中学 。 民国25年，私立莆田中学(俗称公学)初中部自动停办，附属小学由国民政府莆田县政府接收， 改称县立兴贤小学，民国28年春季，迁往常太乡洋坑村上课 。莆田公学堂， 1936年因为抗日战争停校，1942年复校改为私立莆田中山中学，1956年莆田县接管并改名为莆田第五中学，1966年因为文革停校，1973年复校，1988年又更名为莆田中山中学。 1999年秋季高、初中分离，高中部迁往新址：高中部乔迁 位于梅山路的 前福建高级妇幼卫生学校 的地方（福建高级妇幼卫生学校 改制为福建医科大学莆田分校、福建莆田学院医学部）新址 ， 校名沿用莆田第五中学，初中部 改为私立中山中学 ，高中部成为独立高中 ，校名沿用莆田第五中学。
2005年3月学校被确认为福建省普通中学一级达标学校。建校八十一年来，学校的教育教学成绩显著，英才辈出，在社会上赢得了高度赞誉。 特别是近两年，学校的事业不断发展，学校的办学规模不断扩大，现有高中教学班55个，学生数近3000人，教职工295人，其中，硕士研究生共42名，占教师总数的16.4%；特级教师、全国优秀教师及省级优秀教师、学科带头人、骨干教师共23人；市级优秀教师、学科带头人、骨干教师、名师工作室成员共43人；省级优秀班主任、师德标兵51人；高级教师共59人。2011年七月莆田五中学校从梅山街355号搬至凤凰山麓 棠霞街215号，搬迁至新校区，校园占地面积208亩，位于福厦公路旁，毗邻广化寺、万达广场，北临南湖公园，东接荔城大道，西有千年古刹广化寺，周边人文环境优越；
