中华全国台湾同胞联谊会的最高决策机构是全国台湾同胞代表会议，这个会议每三年举行一次，作为其核心组成部分。在会议上，代表们会选举产生理事会，这个理事会进一步选举产生常务理事、会长和副会长。同时，他们还会聘请富有经验的顾问，以提供专业指导和战略建议。
中华全国台联的日常运营机构设有多个部门，包括办公厅，负责协调日常工作；联络部，主要负责与各地台胞的沟通联络；国内部，致力于处理与大陆内部事务相关的事项；宣传部，负责对外宣传和信息发布；研究室，专注于对台湾问题的研究和分析；《台声》杂志社，则是台联的官方媒体平台，定期发布各类资讯和深度报道。
此外，中华全国台联还拥有一个经济实体——中国同源公司，它隶属于台联，主要负责经济活动和发展，为台胞提供支持和服务，同时也有助于促进两岸经济的交流与合作。
中华全国台湾同胞联谊会简称全国台联，于1981年12月27日在北京成立。是台湾同胞在祖国大陆的同乡会组织。中华人民共和国台湾各族同胞的爱国民众团体。以团结联络广大台湾同胞、促进两岸人民交流为己任，为祖国和平统一大业贡献力量，是中国共产党和政府联系台湾同胞的桥梁和纽带。