商洛市国家税务局稽查局是一个隶属于国家税务局的副处级机构，其内部设有六个主要部门，这些部门均为副科级。以下是各部门的职能概要：
1. 办公室: 负责处理日常行政事务，包括文件起草、审核，会议组织，以及秘书、文书档案、政务信息和保密工作。此外，它还负责税收宣传，管理机关财务，以及人事教育、纪检监察、党建工作和工会事务。
2. 综合选案科: 主要负责制定稽查计划、制度和规程，并监督实施。其职责包括安排各类税务案件检查，进行稽查调研，以支持税务稽查工作的有效进行。
3. 检查科: 实施税务稽查，负责日常、专项和专案稽查，以及调查取证和举报工作，确保税收法规的严格执行。
4. 案件审理科: 专司稽查案件的审理工作，包括管理税务稽查委员会的日常事务，组织行政诉讼应诉，并进行稽查报表的统计分析和调研。
5. 案件执行科: 负责税务处理决定的执行，包括案件的督查、督办和考核，确保税务决定得到及时、有效的执行。
6. 举报中心: 专门处理各类税务违法举报，接收转办和交办案件，与司法机关保持协调，维护税收法规的权威和公正。