理学院现有数学、物理学、化学、生物学等学科，其中数学学科中设有系统工程和应用数学两个二级学科，系统工程为学校重点学科，应用数学为学校重点建设学科，并且系统工程学科为博士授权点，应用数学学科为硕士授权点。生物学学科中设有生物化学与分子生物学二级学科，该学科为学校重点建设学科。物理学学科中设有理论物理二级学科，为学校一般立项学科。 理学院学术委员会、理学院学位委员会。
数学学科内设有数学系、应用数学系、数学建模实验室、信息与计算科学实验室和数学与系统科学研究所等。
物理学科内设有应用物理系、物理实验中心和应用物理研究所等。
生物学科内设有生物技术与工程系、生物与化学实验中心、生物工程研究所和应用化学研究所等。 系统工程研究方向为：不确定系统分析与决策、系统优化理论与方法和矿业系统均衡管理等。
应用数学研究方向为：最优化理论与方法、模糊系统与数学、工程数学建模和控制理论与应用等。
生物化学与分子生物学研究方向为：糖生物化学、植物逆境分子生物学和植物蛋白工程等。
理论物理研究方向为：粒子物理与量子场理论和电磁运输理论及工程应用等。 系统工程
学科带头人： 郭嗣琮
学术带头人： 郭嗣琮、高雷阜、张佐刚
学术骨干： 曾繁会、彭晓华、王锦新、董春胜、李 伟、吕明海
应用数学
学科带头人： 高雷阜
学术带头人： 高雷阜、郭嗣琮、曾繁会、彭晓华
学术骨干： 柴 岩、胡行华、王 磊、包研科、刘 威、马 勇、魏 林
生物化学与分子生物学
学科带头人： 刘 莹
学术带头人： 刘 莹、马丹丹
学术骨干： 李芳亮、李 娜、朱宏飞、阎 晗、毛永强、王 锐、王丽威、常敬华、何志明、刘政、赵丽薇
理论物理
学科带头人：王 皓
学术带头人：张永军、王 皓
学术骨干：李本喜、丁红旗、聂 颖、李国臻、张永义、赵 龙
（详情内容参见辽宁工程技术大学理学院-学科建设-学科简介 ）
