基因组序列主要构成成分是 基因序列，重复序列和基因间序列 。
基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释
结构注释的核心是基因识别，为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除
重复的和低复杂性的序列。
重复序列（repetitive sequence）是在基因组中不同位置出现的相同或对称性序列片段，一般不编码多肽。组织形式有两种： 串联重复序列和分散重复序列。 前者成蔟存在于染色体的特定区域，后者分散于染色体各位点。
一般在顺式调控元件如启动子，增强子，终止子等出大量发行，真核生物中广泛分布。
大致分三类：
GC含量低，AT含量高，3'和5'端有直接重复序列存在，有利形成环形结构。
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