直属单位共有12个，分别为：威海市立医院、威海市文登中心医院、威海市中医院、威海市妇女儿童医院、威海市传染病医院、威海市经济技术开发区医院、威海市市级机关卫生所、威海市疾病预防控制中心、威海市卫生局卫生监督所、威海市卫生学校、威海市卫生职工进修学校、威海市中心血站。
威海市立医院：集医疗、教学、科研、急救、预防保健于一体的综合性医院，承担着各种常见病、多发病、急危重和疑难病诊治医疗工作，提供医疗护理、预防保健、康复和卫生咨询等服务。
威海市文登中心医院：融医疗、教学、科研、预防保健于一体的综合性医院，承担着各种常见病、多发病、急危重和疑难病诊治医疗工作，同时担负着当地的传染病防治、预防保健、卫生宣教和急诊急救工作。
威海市中医院：开展中医特色服务，发挥中西医结合的优势，开展常见病、多发病、急危重和疑难病诊治医疗工作，提供医疗护理、预防保健和卫生咨询等方面的服务。
威海市妇女儿童医院：以妇女、儿童医疗保健服务为特色，同时开展其它临床专业各种常见病、多发病、急危重和疑难病症的诊治工作；承担全市职业病诊治工作，开展医学教学、科研、预防保健、卫生宣教和急诊急救等工作。
威海市传染病医院：市区内收治传染性疾病的唯一定点医院,担负着全市传染性疾病的检查、治疗和业务指导工作；承担着市区内所有从事食品、生活饮用水、化妆品和药品生产经营及在公共场所直接为客人服务人员的健康查体工作。
威海市经济技术开发区医院：承担着全市精神心理卫生预防、治疗和保健工作, 开展一些常见病、多发病、急危重和疑难病诊治医疗工作；承担社区卫生、预防保健、急诊急救等工作。
威海市市级机关卫生所：负责市机关干部常见病、多发病的诊断和治疗以及慢性病的保健治疗，提供健康查体、预防保健、卫生咨询、卫生勤务等工作。
威海市疾病预防控制中心：贯彻实施疾病控制和预防保健的各项方针、政策，研究制订我市疾病预防和控制规划、措施，负责全市疾病预防和控制工作的组织实施、技术指导和业务考评；承担全市重大活动的公共卫生技术保障工作，承担对全市传染病疫情的调查处理、应急控制和救灾防病工作，承担全市各类传染病、慢性非传染性疾病及有关常见病防制工作；承担消毒及病媒生物防制的技术指导工作；实施预防接种，负责预防用生物制品的使用与管理；负责食品、化妆品、涉水产品、一次性医疗卫生用品等健康相关产品的卫生学检测、评价；开展公共卫生监测和技术服务工作；开展健康教育与健康促进，参与社区卫生服务工作，促进社会健康环境的建立和人群健康行为的形成。
威海市卫生局卫生监督所：贯彻卫生法律法规，负责全市卫生法制与卫生监督综合建设，承担食品卫生、公共场所卫生、化妆品卫生、职业卫生、放射卫生、消毒卫生、医疗卫生等综合卫生监督执法任务，开展预防医学应用研究。
威海市卫生学校：培养中专卫生专业技术人才，促进卫生事业发展。
威海市卫生职工进修学校：负责全市医务人员的继续医学教育与业务培训；承担威海市医学会、护理学会、中医药学会的日常工作。
威海市中心血站：负责全市采供血的专业机构，开展血液采集、化验、储存等项工作，承担全市各级医疗机构的临床用血和应急用血。
