1、测序与生物信息分析
2、生物与医学纳米技术
3、生物医学材料与器件
4、医学影像与医学电子学
5、儿童发展与学习科学
6、医学信息学及工程 学科特色——多学科交叉，且关注新的学科生长点；即注重在已有优势上进一步发展，同时也支持新的研究方向的发展，已获得协调与可持续的发展。
队伍特色----建设起多学科交叉、结构合理以及富有朝气的创新团队。
科研特色——瞄准和把握生物医学工程的国际前沿领域，如生物医学微纳技术、生物信息学与技术等方面开展具有成效的研究与发展。
人才培养特色——工医复合型人才培养的特色，包括探索7年一贯的工医结合人才的培养途径；双学位人才的培养已经获得社会的好评和极大的需求。在建生物医学工程省级品牌专业。编写、参与编写专著译著五部。2001年江苏省高等教育教学成果一等奖1项，宝钢教育基金优秀教师特等奖1项。 学院有以下四个主要研究方向：
（1）基因组测序与生物信息分析。研究基于生物芯片的全基因组测序方法，发展快速、低成本、高灵敏度的DNA测序技术，研究基因组测序相关的生物信息分析技术，研究人类疾病相关的个体基因组信息分析方法和技术。
（2）生物与医学纳米技术。重点研究生物医学纳米材料的制备与表征、纳米材料的生物相容性、纳米粒子与细胞及亚细胞器相互作用的方式和特点，发展面向临床诊疗的纳米生物医学技术。
（3）生物医学材料与器件。研制新型植入式/非植入式生物电子器件，发展人类器官功能修复技术，研究基于微电子芯片的神经元信号传递机理，研究与生物材料和植入器件相关的生物相容性评价新技术、新方法。
（4）医学影像与医学电子学。研究高速医学超声回波信号的物理学和生理学属性，进一步提高医学超声图像的时间和空间分辨率，研制和开发多用途高速医学超声信号采集系统，研究与发展微型医学仪器。
（5）生物力学。心脑血管疾病是一种严重威胁人类健康的常见病，已成为人类死亡病因最高的头号杀手，也是人们健康的“无声凶煞”，具有“发病率高、致残率高、死亡率高、复发率高,并发症多” —“四高一多”的特点。本方向的研究将积极探索心脑血管的生物力学机理，从而推进心脑血管疾病的预防、诊断和治疗工作。 生物电子学国家重点实验室
生物材料与器件江苏省重点实验室
苏州市生物医用材料及技术重点实验室
无锡市生物芯片重点实验室
苏州市环境与生物安全重点实验室 自2005年至2010年，共承担科研项目212项，其中纵向课题175项，包括国家重点基础研究“973”项目（主持2项，子课题9项），国家高技术863课题22项（经费2968万元），杰出青年基金2项，国家自然科学基金创新研究群体1项（经费720万元），国家自然科学基金重点7项，自然科学基金面上项目60余项，部省级项目50余项，科研经费到款总额为1.3亿元。
