在厦门市委、市政府的大力支持下，2001年，鼓浪屿音乐厅经历了一次大规模的维修改造，耗资千万余元。这一工程于2002年4月顺利竣工，音乐厅焕然一新。
新改造的音乐厅以其优雅的环境和独特的建筑风格引人注目。主体建筑包括前厅、演出大厅（包含舞台、观众席的宽敞空间）、贵宾室、化妆室、钢琴室以及声光控制室，展现了高级的艺术气息。附属设施包括琴房楼、中央空调机房和配电室，为音乐活动提供了完善的后勤保障。
演出大厅可容纳571名观众，以木质材料为主，营造出温馨自然的音响效果。在改造前，其声学品质就得到了多位知名音乐家的赞赏，如1992年上海交响乐团的陈燮阳指挥，他在留言簿上表达了对中国音乐家们的向往和对音乐厅的自豪。经过改造，音乐厅的声场效果进一步提升，赢得了更多音乐家的赞誉。
音乐厅内配备了先进的声光调控和现场录音设备，以及一台七尺德国“斯坦威”和一台九尺意大利“斐芝欧尼”三角钢琴，为音乐表演提供了顶级的硬件支持。琴房楼设有约10间练琴房，每间都配置了钢琴和空调，非常适合音乐培训和练习。
总的来说，鼓浪屿音乐厅的维修改造不仅提升了硬件设施，更提升了其在国际音乐界的地位，成为了音乐艺术交流的重要场所。
鼓浪屿音乐厅于1987年2月建成并投入使用。十多年来，曾先后接待过日本、美国、罗马尼亚、菲律宾、新加坡、俄罗斯、克罗地亚等国家的艺术团体及香港圣乐团、香港青少年国乐团、草田合唱团、上海交响乐团、长影乐团、中国青年交响乐团等的演出。