自收自支事业单位工资标准和全额拨款事业单位工资标准的区别如下：
1、包括的范围不同
自收自支事业单位工资标准包括：行政管理和技术人员，材料采购、保管和驾驶各种机械、车辆的人员，材料到达工地仓库前的搬运装卸工人，专职工会人员、医务人员以及其他由施工管理费或营业外支出开支的人员的工资。
而全额拨款事业单位工资标准包含：个人从事设计、装潢、制图化验、测试、医疗、法律、会计、咨询、讲学、新闻、表演、广告、技术服务、介绍服务、经纪服务、代办服务以及其他劳务取得的所得。
2、处理方法不同
自收自支事业单位工资标准应按年计算，分月或分季预缴。每月终了，企业应将成本费用和税金类科目的月末余额转入“本年利润”科目的借方，将收入类科目的余额转入“本年利润”科目的贷方。
然后再计算“本年利润”科目的本期借贷方发生额之差。贷方余额则为企业实现的利润总额即税前会计利润，借方余额则为企业发生的亏损总额。
而全额拨款事业单位工资标准认为,所得税会计的首要目的应是确认并计量由于会计和税法差异给企业未来经济利益流入或流出带来的影响,将所得税核算影响企业的资产和负债放在首位。而收益表债务法从收入费用观出发,认为首先应考虑交易或事项相关的收入和费用的直接确认,
从收入和费用的直接配比来计量企业的收益。
3、认股权证和股份期权不同
自收自支事业单位工资标准等的行权价格低于当期普通股平均市场价格时，应当考虑其稀释性。计算基本每股收益，作为分子的净利润金额不变；
而全额拨款事业单位工资标准分母的调整项目为按照本准则第十条中规定的公式所计算的增加的普通股股数，同时还应考虑时间权数。当期发行认股权证或股份期权的，普通股平均市场价格应当自认股权证或股份期权的发行日起计算。
4、计算方法不同
自收自支事业单位工资标准计算公式为：
经营净收入=经营收入-经营费用-生产性固定资产折旧-生产税+出租房屋净收入、出租其他资产净收入和自有住房折算净租金等。财产净收入不包括转让资产所有权的溢价所得。
而全额拨款事业单位工资标准计算公式表示为：人均可支配收入实际增长率=（报告期人均可支配收入/基期人均可支配收入）/居民消费价格指数-100%。
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