1、时间跨度不同
魏晋：公元220年—420年。
南北朝：公元420年—589年。
六朝：公元222年_589年。
2、朝代不同
魏晋：魏晋中“魏”指的是三国北方政权曹魏，而“晋”指的是司马氏建立的晋朝。
南北朝：南朝（420年—589年）有刘宋、南齐、南梁、南陈四朝。北朝（439年—581年）则包含北魏、东魏、西魏、北齐和北周五朝。
六朝：即孙吴（或称东吴、三国吴）、东晋、南朝宋（或称刘宋）、南朝齐（或称萧齐）、南朝梁、南朝陈这六个朝代。六朝京师均是南京（孙吴时期名为建业，西晋司马邺称帝后为避讳，改名建康）。
3、时代特征不同
魏晋：
魏晋是中国历史上政权更迭频繁的时期。由于长期的封建割据和连绵不断的战争，使这一时期中国文化的发展受到特别的影响。其突出表现则是玄学的兴起、佛教的输入、道教的勃兴及波斯、希腊文化的羼入。这一时期儒学的发展及孔子的形象和历史地位等问题也趋于复杂化。
南北朝：
出现民族大融合的趋势，比如北魏孝文帝改革，进一步加速少数民族封建化（汉化）的步伐。
六朝：
北方政权林立、战乱频仍的时候，江南地区因远离战场而比较安定，北方人口大量南迁使南方经济在六朝时期得到发展。
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