保持耳套的清洁是提高入耳式耳机密封性和音质的关键。对于通用型耳机，如果耳套导管松弛，应更换新耳套并清洁导管。若出现单侧或双侧无声或音量减小，可能需要更换滤网，使用专用工具清洁。定制耳机的丙烯酸塑料壳可用面巾纸擦拭，确保每次使用后导管畅通无阻。
定期清洁耳套和线材是必要的，特别是与皮肤接触部分，这能延长线材寿命并减少皮脂影响。避免使用酒精或含漂白剂的清洁剂，尼龙布和肥皂即可。取下耳套时，轻柔旋转，避免拉扯以防止损坏。线材可能会硬化或开裂，可更换线材更耐用，有时还能改善音质。
清洁耳机外壳和导管表面时需小心，避免水分进入导管。若意外进水，应立即取出放在干燥通风处，等待24-48小时让水分蒸发。软塑套脏污时，可用温水和肥皂清洗；不可洗涤的海绵套，如弹性减弱或变形，应更换。安装耳套时确保干燥，尽量装到导管根部或卡扣处。
偶尔进行耳烧试验，如将海绵套在滴耳液中浸泡，能清洁耳垢并延长海绵套使用寿命。同样，对于可拆卸滤网和导管开口处的耳垢，此方法也可适用。
入耳式耳机，又名耳道式耳机、入耳式耳塞、或者入耳式监听器（即IEM的英文全称：In-Ear-Monitor），是一种用在人体听觉器官内部的耳机，根据其设计，会在使用时会密封住使用者的耳道。