当企业面临员工的劳动纠纷赔偿时，正确的会计处理是计入"应付职工薪酬"科目。这个科目涵盖了广泛的薪酬内容，包括职工的基本工资、奖金、津贴、补贴，以及社会保险费如医疗保险、养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险，住房公积金，工会经费和职工教育经费，以及因解雇或劳动关系终止给予的补偿。这些支付不仅限于员工在职期间，还包括离职后的相关福利，如因公伤亡职工家属的抚恤金。
会计操作上，企业支付工资、奖金等会借记"应付职工薪酬"，同时贷记"银行存款"或"库存现金"。如果需要扣还员工的个人款项，如代垫的家属药费或个人所得税，操作相反，借记"应付职工薪酬"，贷记"其他应收款"或"应交税费——应交个人所得税"。支付福利费、工会经费和教育经费时，也借记"应付职工薪酬"，贷记相应的银行存款。为员工缴纳的社会保险费和住房公积金，借记"应付职工薪酬"，同样贷记"银行存款"。最后，解除劳动关系的补偿也通过这个科目进行记录，借记"应付职工薪酬"，并贷记现金或银行存款。
以上信息来自于百度百科对"应付职工薪酬"科目的详细解释。