苏州市统计局根据其职责设置了11个正科级内设机构，各部门分工明确，致力于高效运作和统计数据管理。
首先是办公室，负责全局的政务协调、行政管理工作，确保会议决议和指示的执行，组织重大活动，管理政务信息，负责组织人事、党务、文秘、保密等工作，以及国有资产管理和会计预算管理。对于县级市、区的统计经费和基建投资，也进行相应的管理和监督。
法规处主要职责在于拟订地方统计法规，监督执行并进行统计法制建设，查处统计违法案件，制定统计调查计划和实施方案，组织统计教育和资格认证工作。
国民经济综合统计处（经济运行监测调研处）负责经济运行监测、宏观经济咨询，进行全面小康和科学发展评价，提供综合性统计数据和编辑出版统计资料，发布统计数据并进行新闻宣传。
国民经济核算处负责国民经济核算，包括地区生产总值等核算工作，审核统计调查计划，管理基本单位名录库。
工业统计处负责工业统计调查，确保数据的准确性和时效性，指导专业统计基础工作并进行分析。
固定资产投资统计处负责固定资产投资、建筑业等领域的统计调查，确保数据质量和专业指导。
贸易外经统计处负责贸易、餐饮、外经等领域的统计，确保相关数据的全面性和准确性。
人口和社会科技统计处负责人口、科技等领域的统计，监测社会发展水平，组织指导专业统计基础工作。
信息化管理处负责统计信息化的规划实施，管理统计信息系统，保障网络安全，进行数据处理和技术支持，同时也指导县级市、区的统计信息化建设。
服务业统计处负责建立和完善服务业统计体系，实施统计调查，保证数据质量。
能源统计处负责节能减排统计工作，实施能源统计调查，确保数据的准确性和指导专业统计。
最后，纪检组和监察室共同负责内部监督和纪律检查工作。
根据《中共江苏省委、江苏省人民政府关于印发〈苏州市人民政府机构改革方案〉的通知》（苏委〔2009〕413号）和《中共苏州市委、苏州市人民政府关于印发〈苏州市人民政府机构改革实施意见〉的通知》（苏发〔2009〕56号），设立苏州市统计局[1]，为市政府工作部门，正处级建制。