1、投资主体区别：
公司法所指的投资主体应该包括除上述所提及的中国组织，具有中国国籍的自然人，还包括外国的组织和非中国公民的自然人。公司法所规范调整的投资主体是广义上的投资者，没有国界之分。因为企业法是特别法，那么它所规范调整的投资主体可能是公司法所规范或调整的一部分。
合伙人企业是指依照中国的有关法律由合伙人投资的企业。东道国提供的土地、厂房、及其他基础设施、部分原材料等，按商定价格收汇，不参与投资。合伙人企业法所调整或规范的投资对象是合伙人，不包括中国的投资者，也不包括外国的企业或其他经济组织在中国境内的分支机构。
2、组织形式区别：
公司法明确规定了公司的组织形式，就是有限责任公司和股份有限公司两种类型，没有其他类型。
企业法则没有具体规定企业的组织形式，他可以依据公司法的规定成立有限责任公司或股份有限公司，还可以成为其他的企业形式比如说是合伙等。
3、资金制度区别：
公司法规定投资者既可以用货币，实物，也可以用业产权、非专利技术、土地使用权作价出资。
企业法没有明确规定可用土地使用权出资，原因在于中国的土地国有制度，投资者在还不便于取得土地使用权，或其他因素影响了立法者。、
公司法和企业法的联系：
合伙企业是契约式企业，有限公司是股权式企业。我国《合伙企业法》规定，合伙企业是由各合伙人依法订立合伙协议，共同出资，合伙经营，共享收益，共担风险，并承担无限连带责任的企业。
合伙协议是合伙人享受权利和承担义务的依据，合伙人的出资方式、数额和期限，合伙人分配利润和分担亏损的办法，合伙企业的事务执行、解散和清算等问题都按照依法订立的合伙协议来操作。
《公司法》规定，有限公司股东按照比例出资，以其出资额为限对公司承担责任，并且按照投入公司的资本额享有所有者的资产受益、重大决策和选择管理者等权利。
其次，合伙企业不具有法人资格，有限公司具有法人资格，这是合伙企业和公司的最主要的区别。这一区别有两重意义，第一说明合伙企业只具有相对独立的人格，有限公司具有绝对独立的人格。
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