公益性国企与事业单位的区别如下:
1、认股权证和股份期权不同
公益性国企等的行权价格低于当期普通股平均市场价格时，应当考虑其稀释性。计算统账结合，作为分子的净利润金额不变；
而事业单位的调整项目为按照本准则第十条中规定的公式所计算的增加的普通股股数，同时还应考虑时间权数。当期发行认股权证或股份期权的，普通股平均市场价格应当自认股权证或股份期权的发行日起计算。
2、税率不同
公益性国企的税率是17%，可以抵扣开具了增值票购进货物的税额;公寓的税率是4%(商业)或6%(工业)。但是不能抵扣进项税金，也不能开具增值税发票，同时事业单位购进小规模的货物也不能抵扣进项税金。
3、开发票时填写的信息不同
公益性国企远期市场需要在申报的“购买方纳税人识别号”栏填写购买方的统一社会信用代码。购买方为企业的凭证，索取申报时，应向销售方提供统一社会信用代码。
而事业单位有何联系为其提供开小规模纳税人时，应在“购买方纳税人识别号”栏填写购买方的纳税人识别号，不符合规定的发票，不得作为税收凭证。
事业单位是具有唯一性的，只要税务发票系统里面查到了这家企业的发票代码不同，就可以查询到这家企业的进销项发票情况，也就可以知道企业是否虚开发票了。
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