纪委（督察室）的主要职责包括：检查执行国家路线、方针、政策、法律法规的情况，对党纪政纪进行监督，查处违纪案件，加强党风廉政建设和纠正行业不正之风，进行党纪政纪教育，受理检举、控告和申诉，审议纪律处分事项，以及开展执法监察等工作。
总工室主要负责公路系统的技术管理工作，参与规划和年度养路计划编制，指导公路改造等工作。
工会的工作重点是维护职工权益，组织竞赛活动，关心职工生活，建设职工之家，开展工会经费管理，参与职工劳资和安全生产，以及工会档案管理等。
办公室的职责包括收集信息、提供决策参考，处理机关日常事务，管理公文和会议，负责印章管理和保密，档案管理，处理人大议案、政协提案等，以及车辆管理和办公设备采购等。
政工科负责党委日常工作，党团组织建设和干部考察，职工教育、考核、劳资和社会保险，人才招聘、职称评聘等人事管理工作，以及史志编写工作。
工程科负责工程规划、计划编制，工程质量检查，工程变更管理，技术培训和交流，项目招投标，报表管理和档案整理等。
养护科致力于公路养护与管理，制定年度计划，监督执行，桥梁养护指导，新技术推广，统计报表管理，以及工程招投标等。
路政管理大队负责路政法规宣传，超限运输审批，路政装备管理和执法，参与公路工程验收，以及法律规定的其他职责。
计划财务科负责执行财经政策，制定财务规定，编制和监督养护及通行费计划，管理资金，会计报表编制，固定资产和流动资产核算，会计档案管理，以及参与工程预决算审核等。
安全监督管理科执行安全生产政策，组织安全监管工作，负责安全生产许可评审，安全宣传教育，事故隐患整改，以及突发事件处理等。
合肥市公路管理局主要负责全市国道、省道和重要县道的规划、建设、养护、管理以及机动车辆养路费征稽、车辆通行费征收工作，指导所属企业发展。行政（人权）隶属市交通局领导，业务（财权、事权）隶属省公路局管理。