大致一样。灵活就业和个体工商户都可以自己交纳社保，相同点：
1.参加的都是职工养老保险和职工医疗保险，各种待遇跟企业职工是一样的。
2.缴费比例，都享受灵活就业人员的优惠。灵活就业人员个人需要承担企业和个人部分负担比较重，因此国家在缴费比例上会有特殊照顾，比如企业缴费是8%+18%，而灵活就业人员和个体工商户缴费是20%。
不同点：1.参加的险种数量不同。灵活就业人员参加的保险主要包括两险或甚至一险。个体工商户参加的保险是五险。尤其是有雇工的个体工商户，实际上个体工商户也是企业老板，应当给打工者交纳社保五险，应对工伤、生育、失业等待遇。
2.享受补贴不同。灵活就业人员参保缴费，可以享受灵活就业人员补贴。这是一种面对就业困难人员的灵活就业者，降低他们社保交费的一种方式。政府一般补贴50%~70%。享受期限一般是三年，距离退休不足五年首次申请的可以延迟至退休。
个体工商户一般属于创业群体了，可以享受的是一次性创业补贴。
交哪种合适呢？如果只需要养老缴费，那么就参加灵活就业人员保险。如果是年轻人，希望保障全一些，那么就参加个体工商户保险。尤其是工伤待遇，生育待遇以及失业待遇，还是非常不错的。
不管是灵活就业人员保险还是个体工商户保险，两者的退休待遇都是一种计算公式，只跟缴费年限和缴费基数等因素有关