1．农业生态系统是一个自然、生物与人类社会生产活动交织在一起的复杂的大系统，它是一个“自然”再生产与经济再生产相结合的生物物质生产过程。所谓“自然”再生产过程，是指种植业、养殖业与海洋渔业等，实质上都是生物体的自身再生产过程，不仅受自身固有的遗传规律支配，还受光、热、水、土、气候等多种因素的影响和制约，即受到自然规律的支配。经济再生产过程，是指农业生产是按照人类经济目的进行的，投入和产出，受到经济和技术等多种社会条件的影响和制约，即受社会经济规律的支配。人类从事农业生产，就是利用并促进绿色植物的光合作用，将太阳能转化为化学能，将无机物转化为有机物，再通过动物饲养，以提高营养价值，使农业生态系统为社会尽可能多地提供农产品。同时，人类运用经济杠杆和科学技术来提高和保护自然生产力，提高经济效益。
2．发展农业，必须处理好人、生物和环境之间的关系。要按照生物与环境相统一的基本规律来指导和发展农业生产。种植业和林牧渔业生产都是生物体的再生产过程，各自与其环境之间建立了多种类型的“自然”的生态系统。只有生物与非生物环境之间相互协调、相互适应，农业生产才能获得最优化的效果。所谓顺天时，量地利，则用力少而成功多，反其道而行之，则劳而无获。农业生产是一个能量与物质流通过程，无论能量与物质提供者的环境条件或者是生产者的生物体，在一定时空条件下，它们的生产能力都是有一定限度的，超过其极限，就会造成生态平衡的破坏，使自然资源衰退，农业生产下降。由于捕捞强度过大，超过了渔业资源的再生能力，致使中国主要海洋经济鱼类的资源日趋枯竭。同样，在耕地利用上，忽视养用结合，以致土壤肥力严重衰退，引起土壤退化。在大量的物质和能量随着商品流出农业生态系统之后，就必须从外界投入足够的物质和能量，才能保持其平衡。因此，对农业资源不能只顾利用，不断索取，必须加以保护，使之休养生息，才能促进资源增殖，提高农业产量。 农业用水污染及由此导致的农田土壤污染、农药和化肥污染也时有发生。这一切均严重影响着农业的持续发展和粮食的安全。所以，农业环境保护已成为迫在眉睫的重要问题。
