常年从事职级管理工作，我来回答一下，很明确告诉你，二级主任科员2年后，有职数空余，完全可以晋升一级主任科员。
2019年6月之后，新的职级制度实施，将原来的非领导职务取消，新设了职级制度。职级制度和原来非领导职务比较起来，最大的变化就是职数按照编制来核定，而不再是按照领导职数来核定。所以对于好多单位来说，职级职数比较和原来的非领导职务职数比较，职数总量是增加的。
你现在副科能够晋升到二级主任科员，享受正科级经济待遇，说明你们单位职数是比较富裕的，而且说明你的表现是比较优秀的。这种情况下你的进步分为两个方面：一是职务方面的进步；二是职级方面的进步。
先看职务的进步。 作为副科级领导干部，能够晋升二级主任科员，说明你的副科级任职年限超过了4年，是完全可以晋升正科级领导干部的，而且现在二级主任科员理论上也可以直接转任正科级领导干部。所以如果你还年轻，事业还有发展空间，那么下一步你的努力方向应该是尽快实现职务由副科到正科的转变。晋升正科级领导干部之后，晋升一级主任科员肯定是没有问题的。
二是职级的晋升。 作为副科级领导干部，已经晋升到二级主任科员了，这种情况在我们这里一般要免去副科实职的。下一步有职数空余，可以在二级主任科员满2年后晋升一级主任科员。如果你的年龄比较大，而且个人对于实职领导干部的权力不留恋，那么建议你申请免去实职，转任职级干部，这样下一步晋升的时候一般会优先考虑考虑的。
最后，祝愿顺利晋升一级主任科员。
我在单位就是负责这项工作，所以可以责任的告诉你，两年后你肯定满足晋升一级主任科员的条件，而且副科长兼任一级主任科员完全没有问题，但能否晋升还有其他因素。
第一，任职年限。 《公务员职务与职级并行规定》：晋升一级主任科员，应当任乡科级正职或者二级主任科员2年以上；你在两年后能满足任二级主任科员2年以上这个条件。
第二，有职数。 这个职数在省直以上单位是没有限制的，但在市县却有比例限制。市县一级至四级主任科员不超过机关综合管理类职位数量的60％，而其中一级、二级主任科员不超过一级至四级主任科员总数的50％，一级主任科员职数不会超过单位编制的30%。这个在一些单位套改后就基本空缺不多，晋升一、两次后基本不剩了。所以要两年后还有职数，你可能至少在市直单位或省直单位。
满足以上两个条件，是不是就可以直接晋升一级主任科员的呢？那可不一定。 最最关键的还需要单位研究确定你为晋升人选。 晋升职级也需要像晋升职务一样综合考虑民主推荐、民主测评与平时考核、年度考核、一贯表现等情况确定人选。说白了就是领导要同意你晋升。如果领导同意你晋升，而且你也满足基本的条件，那么就可以走程序晋升职级了。
副科长兼二级主任科员理论上满足任职年限后，在有名额空缺的前提下可以晋升一级主任科员，但如果要晋升副科实职肯定不能再兼了，否则职务与职级跨度太大两头占便宜会引来很多非议，被人背后戳脊梁骨，除非你晋升了正科实职再兼任一级主任科员，才能让人无话可说 。 这是职务与职级晋升的基本规则
按照公务员职务与职级并行规定，原来的非领导职务统一要改套职级，其中副主任科员对应四级主任科员，主任科员对应二级主任科员。实职领导不套改，但可以晋升，首次晋升后在有职数名额的前提下，符合条件的可以二次晋升，之后任职年限全部清零重新开始计算。换言之，无论是非领导职务改套职级后的晋升，还是领导职务的直接晋升，首次职级并行只允许有两次晋升的机会。
如果是副科长，任职年限满四年以上，在有职数名额的前提下，首次可以晋升三级主任科员，然后有名额还可以继续晋升二级主任科员，晋升后任职年限清零开始重新计算。也就是说，在不免去实职的情况下，副科长是可以连续两次晋升到二级主任科员并兼任职级的，即副科长兼任二级主任科员。之后继续晋升，则要从二级主任科员开始重新计算任职年限，满足两年以上任职条件，在一级主任科员有名额的情况下，可以继续晋升一级主任科员。在职级晋升上，这没有问题。但是晋升职级后，副科长能不能保留就另当别论了。从现实操作来看，几乎可以确定100%不能保留副科实职。道理很简单，职务与职级跨度太大，组织上不可能允许职级比职务高两三个等级，还允许其继续兼任实职领导职务，这既不符合职级并行的初衷，对其他人也是种伤害，明显存在不公平。
因此，副科长兼任二级主任科员如果要晋升一级主任科员，只能有两种方式：
第一，免去副科长职务，只保留二级主任科员职级， 二级主任科员职级任职满两年以上，在一级主任科员有名额的情况下，继续晋升一级主任科员，不兼任任何领导职务。这是目前各地比较通用的做法。晋升职级后，一律免去实职，既盘活了职级资源，也拓宽的职务晋升空间，给更多人机会。
第二，晋升正科实职岗位，不兼任二级主任科员 ，然后在正科任职满两年的情况下，视一级主任科员职级名额晋升，有工作需要，正科实职可以兼任一级主任科员，不是绝对必要，很大概率要免去正科实职，只保留一级主任科员职级。也只有在这种情况兼任一级主任科员，其他人才没有说法。如果是由副科长兼任一级主任科员，绝对会引来其他人投诉。这点毋庸置疑。
一句话，副科长兼二级主任科员理论上可以晋升二级主任科员，实际操作中想晋升一级主任科员兼任副科长绝对不可能。
理论上是完全可行的！
你现在是副科实职，享受正科待遇。下步发展，既可以走领导职务升正科实职，也可以走“待遇路线”由二级主任科员升一级主任科员。
但规定是死的，掌管规定的人是活的。所以，下步能不能进一级主任科员，说到底还是你单位说了算！建议：
1.能升就升。 下步单位可能给你升正科实职，但还是只享受二级主任科员待遇。不管怎样，能升就是好事。
2.职务优先。 你还年轻，应当把以走领导职务为主。只要调上了正科实职，一级主任科员是迟早的事。反过来，一级主任科员不见得能当上正科实职！
3.两年后，如果单位既不给你升正科实职，也不解决待遇问题，那么你也应该正确对待。 毕竟，满两年是基本条件，并不是说满条件就一定必须升职。
记住：职位和需求永远都不对等！“僧多粥少”是常态！希望你能有个好心态面对现实！我是 @职场探秘者 ，欢迎关注交流！
理论上可行的，实际工作中很难。
本次机构改革中，开始实行职级并行。《公务员职务与职级并行规定》要求，晋升一级主任科员，应当任乡科级正职或者二级主任科员2年以上。理论上二级主任科员兼任副科长两年后是符合晋升一级主任科员的要求的。
但是在实际操作中，一般先由二级主任科员重用为科长，再由科长晋升一级主任科员，很少出现二级主任科员兼任副科长直接晋升一级主任科员的情况。
职级并行，本人副科长兼二级主任科员。2年后，在有职数的情况下，能否晋升为一级主任科员？副科长可以兼任一级主任科员吗？回答是：完全可以。
职级并行，重点在一个“并”字上。“并”字的最主要的含义，是在“三定方案”规定的领导职数职级晋升的道路旁，又开辟了另外一条职级晋升道路。即在职数之外，规定了职级名额，以及职级级别。在规定的名额内，可以在不晋升职务的情况下，晋升职级，享受更高职级待遇。“并”字还有一层含义，就是职务与职级可以“并有”，可以同时担任职务并晋升职级，按最高级别享受待遇。也就是说，如果是正科级局长，同时晋升为一级主任科员，可以选择享受一级主任科员的待遇，因为一级主任科员比正科级实职待遇高半级，还不影响该人享受单独给实职享受的福利待遇。
举例说明：某县级局有行政编制50名，“三定方案”规定领导职数4名，一正局长，三个副局长。按“职级并行”规定，允许有一至四级主任科员30名，其中一二级主任科员最多15名。也就是说，正局长可以在条件符合的情况下，晋升为一级主任科员。由于该局还有一个三四级调研员名额，如果该局长符合条件，还可以晋升四级调研员，两年后继续晋升三级调研员。这是理论上可以享受的最高待遇，对于正局长来说，关键因素在于其任正科级年限。
对于副局长而言，首次晋升三级主任科员，如果满足年限要求，可以继续二次晋升为二级主任科员，以前的任职年限清零。两年后满足条件，可以直接晋升一级主任科员，这不存在名额问题，因为一二级主任科员使用的是同一个名额。在晋升一级主任科员三年后，如果有四级调研员名额，还可以继续晋升四级调研员，享受副处级待遇，两年后晋升三级调研员。也就是说，虽然起步晚，但只要有名额，副局长理论上也可以最高晋升到三级调研员。
当然，有的地方为了平衡关系，为了增加享受高级别待遇人数，将职务与职级分开：选择保留职务，就不能晋升职级；选择享受职级待遇，就不能保留职务。职级并行政策规定中，并没有职务与职级必须“二选一”的要求，这主要看地方党委、组织部门如何规定了。
完全可以，这就是职务与职级并行。我与你分享一下我一个朋友的经历。他是县文联副主席，与你一样是副科级，二级主任科员。前几天，他们单位有一个一级主任科员的名额，他又晋升了一级，现在是文联副主席（副科）、一级主任科员。听单位搞人事的同事说，再过两年，只要单位有名额，他又可以进四级调研员了。
下面我说一下晋升职级的基本条件：
一是政治素好。
二是具备职位要求的工作能力和专业知识，忠于职守，勤勉尽责，勇于担当，工作实绩较好。
三是群众公认度高。
四是符合拟晋升职级所要求的任职年限和资历。晋升一级主任科员，应当任乡科级正职或者二级主任科员2年以上。
五是作风品行好，遵纪守法，自觉践行 社会 主义核心价值观，清正廉洁。
看到你这个问题，明确的告诉你，美好的想法是不可能实现的，具体原因：
按照目前的职级并行的制度，你这个想法貌似可以实现，再有职数的前提下，晋级貌似顺理成章，但是实际的执行中，则要复杂的多。
首先，在一个单位的实职个数和职级个数都是有限的，和以前的差不多类似，你任职了副科长，就不能任职主任科员，任职了主任科员，肯定不能兼职正科了啊，现在的职级并行也有次类似的情况，每个单位的职数都是有限的，不可能有你先任职了副科，在一路晋级到主任科员一级的情形出现，毕竟，在单位不止有你一个人需要晋级，多年的副科长、一直处于非领导职务的二级主任科员等，都在等着晋级。
其次，像你这种情况，在职级并行执行以后，一般都会采取下面的程序，副科长兼职二级主任科员，要么主动放弃副科长职务，晋级一级主任科员，让其他的人员任职副科长，要么升职正科长（在有职数的情况下），一级主任科员由更需要的人来任职，你的一级主任科员，则需要等到下次或者下下次在解决了。
最后，目前已经执行了职级并行，但实际上是增加了干部晋级的速度，只是说干部晋级的机会大大增加了，就拿科级来说，以前执行的是两级四阶职务（副科、正科，副主任科员、主任科员），而现在则成了两级六阶职务（正科、副科，主任科员一、二、三、四），实际上在科级这一职务上，需要花费更多的时间，毕竟即使你任职副科，那么在3年的时间也不可能晋级到三级主任科员，同样，你任职正科以后，要到主任科员一级，也需要一定的时间，而且，在你没有升到一级主任科员的情况下，是不能升任副处级的（职级并行，肯定要全部满足才可以晋级上一层及的）。
我以我们市直单位的晋升程序回答题主：理论上可行，实际上可能不行，因为题主的任职年限和副科职务没有竞争优势。当然，题主任二级主任科员满5年或者更长，或许可以晋升一级主任科员，或者等到题主单位科长都晋升为一级主任科员后，题主才有希望。
1、 任二级主任科员或者正科级领导职务满2年。公务员职级并行规定，晋升一级主任科员，需任二级主任科员或者正科级职务满2年。满2年是最低任职年限，不满2年的，原则上不能晋升。这是核心条件。
2、 必须有一级主任科员的职数空缺。有职数空编，才能够晋升填补，这是公务员晋升一般原则。否则就超编了，超编是违反规定的，编办或组织部也不会承认，一把手还要被约谈。
3、 能进入单位晋升一级主任科员的预备名单。每个单位的职级晋升都有自己的规定，这种规定带有明显的地方特色或者单位特色。比如我们单位就对每个职级晋升，作了详细的量化打分规定，一级主任科员的规定是这样的：①任二级主任科员每超过1月计1分，不满一月的按1月计算；②任正科级职务每超过1月计3分，不满一月的按1月计算；③担任过副科级职务每超过1月计0.5分，不满一月的按1月计算；④获得优秀公务员1次计5分；⑤收到市委市政府以上部门表彰的1次计10分；⑥受到处分的另行规定。
4、 通过组织考核。满足以上3个条件并不确保一定能够晋升，还要通过组织考核、民主测评。这和以前县以下职级并行不一样，以前是只要满12年、15年即可晋升，不需要考核，也不需要职级空编。
按照上述四个条件要求，在量化打分方面，正科级任职1月打3分，二级主任科员才打1分，正科级干1年相当于二级主任科员干3年，副科长职务肯定干不过正科级的科长。仅凭这一条，二级主任科员就落后科长2年。在任职年限方面，题主二级主任科员刚满最低年限的2年，这也不占优势，毕竟单位任二级主任科员超过2年的人员太多了，有的甚至满5年或者更长。又凭这一条，题主也不占优势。
以我们市直单位为例，这样的情况是几乎不可能发生的，晋升一级主任科员大多都是科长优先，若再有剩余的职级空缺，可以给量化打分排名靠前的人。因此，题主副科长兼二级主任科员任职满2年，想晋升一级主任科员太难太难。
1、熬年限。也就是在二级主任科员多熬一熬年限，时间长了，职级晋升的量化打分自然就高了，排名自然靠前。
2、调职务。现在是副科长，量化打分低。如果调整为科长，量化打分就高了，可以一下提高2倍的分数。再说，正科级职务是优先晋升职级的。
副科长是副科级实职领导，按职务职级并行前的规定，享受副科级待遇。
职务职级并行后，一些资历老，任职时间的长的副科长，可以进行职级晋升。题主目前兼任二级主任科员，应该是进行套改后两次职级晋升而来的（第一次晋升三级主任科员，第二次晋升二级主任科员）。两次晋升后，原任职时间归零。今后在满足任职时间和岗位空缺的条件时，还可依次晋升更高职级。
我管理的单位有一个实例：有个老同志2012年任副科级干部，去年职务职级并行时连升两级成了二级主任科员，明年单位有个一级主任科员空缺，他就可从二级主任科员升任一级主任科员职级了。
因此，题主在二级主任科员任职满两年后，如果单位有职数，是可以晋升为一级主任科员的。