（一）综合司
负责机关日常运转和财务、资产管理工作；承担能源行业统计、预测预警和统筹协调能源应急有关工作；承担政务公开工作；承担国家能源委员会办公室日常工作。
（二）政策法规司
研究能源重大问题；组织起草有关能源法律法规和规章草案；承担有关规范性文件合法性审核工作；承担相关行政复议、行政应诉工作；承担新闻发布工作；组织拟订能源产业政策。
（三）发展规划司
研究提出能源发展战略的建议；组织拟订能源发展规划、年度计划；承担能源综合业务；承担能源体制改革有关工作。
（四）能源节约和科技装备司
指导能源行业节能和资源综合利用工作；承担科技进步和装备相关工作；组织拟订能源行业标准；拟订炼油、煤炭加工转化为清洁能源产品的发展规划、计划和政策并组织实施。
（五）电力司
拟订火电、核电和电网有关发展规划、计划和政策并组织实施；承担电力体制改革有关工作；组织核电厂的核事故应急管理工作。
（六）煤炭司
承担煤炭行业管理工作；拟订煤炭开发、煤层气发展规划、计划和政策并组织实施；承担煤炭体制改革有关工作；协调有关部门开展煤层气开发、淘汰煤炭落后产能、煤矿瓦斯治理和利用工作。
（七）石油天然气司（国家石油储备办公室）
承担石油、天然气行业（含管道）管理工作；拟订油气开发的发展规划、计划和政策并组织实施；承担石油天然气体制改革有关工作；承担国家石油储备管理工作，监督管理商业石油储备。
（八）新能源和可再生能源司
指导协调新能源、可再生能源和农村能源发展；组织拟订新能源、水能、生物质能和其他可再生能源发展规划、计划和政策并组织实施。
（九）国际合作司
承担能源国际合作工作；拟订能源对外开放战略、规划及政策；协调境外能源开发利用；承担机关外事工作。
（十）直属机关党委（人事司）
负责机关和局直属单位的人事（退休干部）管理工作、党建工作、精神文明建设和纪检监察工作；指导机关工会、青年和妇女工作。
