地宫距地表深26米，墓道全长50余米，墓室全长20.6米，分前后两室，平面呈“T”字形，封土面积约1.3万平方米。发掘前保存完整。这座工程浩大的陵墓，系在山上凿石开圹，然后用砖砌垒，动用土石方约20万立方米。据专家估计，按当时情况，以二百个劳动力计算，需二、三年时间才能建成。墓道正直向南，外口宽，向里渐窄，呈外高里低斜坡状，里口宽3.9米，北距金刚墙1.5米。墓道内筑有用石灰、糯米汁、豆汁混合浇铸的三道挡土墙，其中第三道墙亦称封门墙，高8.86米，上部厚1.6米，向下渐宽作砥墙状，墙基向外伸入墓道中。墙用大砖砌成，封堵牢固，至今痕迹可见。
封门墙后为红色金刚墙，通高8.2米，宽5.35米，上部是用绿色琉璃砖、瓦筑起的门楼，墙面敷一层坚硬的红灰泥。门楼的上部、左、右、后三面附有砖砌的档土墙，与前面的挡士墙接齐。在门楼上又筑起一道东西长条形的护槽，顶上覆盖两层石条，用以负担上面的夯层封土，防止损坏门楼建筑。墓门在金刚墙下部的正中，门洞高2.4米，宽2.25米。上部用一米厚的石条横担，已有裂痕，洞口以砖封门。墓室通长20.6米，共有两重门，分前后两室，两室之间有甬道相连，除门部为石料制成外，余为砖砌券顶，方砖铺地，四壁及顶部敷以白灰，壁上饰双条墨线。两道门形制相同，第一道门缩入洞口1.5米处，双扉枢轴式。墓门以整块巨石做成，高2.4米，宽1.3米，厚0.2米，每扇重约1500公斤。正面雕有纵横九排乳状门钉，门涂朱漆，门钉贴金，镶有铁质涂金铺首衔环，色泽鲜艳。门环以长57厘米的插簧式铁锁锁住。地宫的前室，南北长8.05米，东西宽5.25米，高4米，顶部为东西起券。甬道的券顶较矮，高1.9米，长1.95米。后室为棺室。南北长5.45米，东西宽8.2米，较前室高大宽敞。前室正中部置一大缸，直径1.1米，高1.5米，缸内有铁芯灯座，即万年灯。后部中央设一张红御案，案西侧有盏顶宝匣，内盛“鲁王之宝”印，印匣原应在案上。中部随葬品有庞大的木雕彩绘俑群，共432个，分别为仪仗俑、车、马等。比例相称，刀法简练，神态各异，形象逼真。有手持金瓜、钺斧、朝天镫、刀、枪、剑、戟的武俑；有手持各种乐器的乐俑；有拱手而立的文官和身材魁梧的侍卫。后部中央设御案一张，案上放盝顶宝匣3只，内置木制贴金的“鲁王之宝”印。
后室中部砌有南北长3.85米，东西宽3.1米，高0.5米的砖质须弥座，朱漆金丝楠木棺椁，置于棺床之上。棺床两边有桌8张，其中4张为镶砾石桌心。东侧放有两个戗金漆箱，内装冠、冕、袍、靴和玉圭、玉带等，两边桌上放文房四宝和琴棋书画等物。其他随葬品为木、竹、铜、锡做的小冥器。随葬品的摆放，体现了古代帝王“事死如事生”“厚葬以明孝”的思想。 朱檀墓西60余米处，有王妃戈氏墓，地面有何建筑，史无记载，墓室较鲁王墓浅，距地表约8米，墓室为砖砌券顶，分前后两室，通长15.2米，宽4.3米，高4.13米，前后室两侧及后壁各有一龛室，当为放置随葬品之用。墓门高2.3米，宽1.3米，厚0.2米，为双扉枢轴式，共两道石门，以自来石支顶。从建筑工艺上看，做工远不如朱檀墓精细。据《鲁王妃圹志》载：“妃戈氏乃良家子入侍亲藩，洪武二十三年封为鲁王妃。子一人肇辉，嗣封鲁王。正统五年十月初九日以疾薨，享年72岁，以薨之次年4月19日葬于九龙山之原。”
据史料可知，戈妃死时朱檀早已下葬，因鲁王是第一个薨逝，未定合葬丧制，所以衬葬于此。戈妃墓于1975年被当地农民耕地时发现，墓中文物被盗窃一空。
朱檀墓出土各类珍贵文物1300余件，是山东省建国后发掘最完整，出土文物最丰富的明代亲王墓葬。它充分显示明代劳动人民的聪明才智，是劳动人民智慧的结晶。它是明代王族生活的缩影，为我们研究明代亲王生活提供了丰富的资料。
