1872年3月9日，加拿大基督长老教会宣教师马偕‧叡理博士（Rev. Dr. George Leslie Mackay）登陆淡水，作布教、教育及医疗工作。择定淡水炮台埔小山丘上（真理大学现址），兴建校舍，并亲自规划监工。
1882年校舍建成后，为感念其家乡安大略省牛津郡（Oxford County）居民的捐助，遂命名为Oxford College，中文名为：理学堂大书院，后人称之为牛津学堂。当时所授的课程，除了神学圣经道理，尚有社会学的历史、伦理、中国字部、中国历史，自然科学的天文、地理、地质、植物、动物、矿物以及医学理念、解剖学及临床实习等。
1959年，真理学院创办人“北部台湾基督长老教会”为继承马偕博士对台湾文化、教育、医疗的功劳与贡献，决议在淡水“牛津学堂”原址，筹设大学。
1965年8月奉台湾当局教育部核准设立“私立淡水工商管理专科学校” ，英文校名为“amsui Institute of Business Administration”，招收三年制及五年制专科学生。创办人派蔡培火先生为董事长，聘彭淑媛博士为校长。
1971年4月，董事会聘叶能哲博士为第二任校长，改英文校名为Tamsui Oxford College。
1991年6月，为发展成为综合大学的初衷，增购台南市麻豆区的校地一八‧七七三八公顷为分部，与淡水校区校地九‧三三九公顷并计有二十八公顷。
1994年8月1日，奉准改制为四年制独立学院，定名为：私立淡水工商管理学院，英文校名为Tamsui Oxford University College。
1996年11月，麻豆分部落成，设有二年制技术学群。
1997年2月，第一次招收春季班学生。
1999年8月1日，奉“教育部”核定改名为“真理大学” ，英文校名为Aletheia University(此为希腊语真理的意思)。分为人文、数理、财经、管理、观光、语文、知识经济七个学院，内含数理科学、管理科学及财经三个研究所暨宗教学系硕士班、三十个学系与六个二年制技术系在职班。陈庆中牧师为第一任董事长，现任董事长为郑献仁牧师，原学院校长叶能哲博士为真理大学第一任校长。
