2011年药博会由安徽省人民政府、中国国际贸易促进委员会和中国中药协会共同主办，由亳州市人民政府、中国国际贸易促进委员会安徽省分会、安徽省食品药品监督管理局、 中国北京同仁堂（集团）有限责任公司和康美药业股份有限公司联合承办，得到了商务部、科技部、卫生部、国台办、国家体育总局、国家中医药管理局 、国家食品药品监督管理局、世界中医药学会联合会、中华中医药学会和中国医药保健品进出口商会的鼎力支持。
大会以“中医药，让人类更健康”为主题，以“弘扬中医药文化，加快中医药产业发展，促进中医药造福人类”为宗旨，树立“人文药博、生态药博、科技药博、养生药博”理念，采取政府主导、社会参与的市场化运作机制，把2011年药博会办成以药为媒的招商平台，以药展为载体的贸易平台，以国际化为目标的合作平台，以中医药养生文化为内涵的学术平台和“中华药都、养生亳州”城市形象的展示平台，推进千亿元现代中药产业基地和国家中药现代化科技产业（安徽）基地建设，共安排经贸、学术、文化三大板块12项活动。
经贸板块突出展览展示、招商推介和经贸洽谈，设置了2011年国际（亳州）中医药展、2011年国际（亳州）药材药品交易洽谈会暨签约仪式和2011年中国（亳州）投资环境说明会暨项目签约仪式等3项活动。
中医药展共设置了“中成药、中药饮片、中药保健酒、中药日化产品、中药保健食品饮品、中药消毒液杀菌剂、兽用中药、医疗器械、药械、健身气功相关产品”等展区。
本届中药材交易会已纳入商务部内贸领域支持展会，根据财政部办公厅、商务部办公厅《关于2011年流通领域放心肉服务体系等项目资金安排有关问题的通知》（财办建[2011]52号）精神，对境内每个参展企业按展位费的70%进行补贴，补贴金额最高可达一万元。
学术板块更具针对性，共设置了2011年中医药国际化发展论坛、第五届全国知名中医院院长论坛、中医院药事管理经验交流研讨会暨小包装中药饮片推广使用标准化论坛和中药调剂与合理用药学术研讨会等4项活动，届时国内外知名中医药企业、中医药知名专家、中医院院长、药剂室主任将云集药都。
文化板块在内容上更加丰富多彩，将举办华佗诞辰1884周年祭祀大典、2011年亳州第二届中国健身气功博览会暨第三届华佗五禽戏养生健身节活动、“中医药，让人类更健康”文化广场活动、开幕式暨主题晚会和闭幕式焰火晚会等5项活动。
