利用现有品种的自然变异群体，通过选择的手段而育成新品种的途径叫做选择育种，简称选种。群体的遗传变异是选择的基础，选择的实质是差别繁殖。
大蒜的选择育种多采用单株选择法。
预选和初选：从良好的供选园圃中用目测法选择发育良好、无病毒表现、具有综合优良特性的优良单株100个作为预选株，编号挂牌并登载。预选可分期进行，分别在不同时期测定所需指标。
复选：初选株繁殖成营养系的苗，栽植在复选圃内，各株系与顺序不设重复。复选阶段要制定详细的调查记载和统计分析项目，如产量因素、植株健壮程度、感病情况等，应特别注意有无病毒感染。从复选圃蒜头收获期，要进行复选，一般产量和质量超过初选优系平均值可作为复选株系。
决选：复选优系繁殖成的第二代营养系苗栽入决选圃，3～5次重复，每一重复设一小区，栽植密度与当地生产园相同，便于在总株数较多，有重复的条件先对复选株系的主要经济生物学性状和是否受到病毒侵染作进一步鉴定，消除土壤和病毒引起的误差。同时安排在2～4个生态条件不同的产区进行区域试验，鉴定其在不同生产条件下产量、品质及适应性表现。根据决选圃及区域试验试验结果和现场考察做出决选，表现最好的1～2系作为决选营养品系。报审后颁发品种证书，同意在生产中繁殖推广。
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