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当前搜索:
如何找到蛋白的fasta
怎样
将氨基酸存为
fasta
格式
答:
在\“Enter accession number(s), gi(s), or
FASTA
sequence(s) \”输入你要查询的氨基酸序列,然后点击左下角的\“blast\”,搜索结果是好多个
蛋白质的
...斑马鱼,线虫,酵母,果蝇)并将其转换为
FASTA
格式
答:
这是生物信息学比对的问题,你上网到GENEBANK,然后把编号输入进行搜索,就像用百度一样,系统会为你搜索出这个编号对应的
蛋白质的
一系列信息,包括序列和文献等等,下面就自己开始探索吧,
FASTA
格式也是一种计算机排列氨基酸序列的格式,这个问题挺先进,我喜欢.当然看懂那个网页你英文也要不错才行.给你个网址http:...
单个基因的生物信息学分析-基因结构与功能分析
答:
根据图2所示,将
fasta
序列输入,选择小麦(triticum aestivum),然后search。图3展示了分析结果,可以看到序列比对到了正义链,只包括黄色的部分,即CDSo序列,与使用的转录本相吻合。下面的是该基因对应的mRNA序列,同样为1152bp,最下面的是将该mRNA翻译为
蛋白质的
序列。二、如果我们想分析一段区间内的...
生信笔记:
蛋白质
序列 CARD注释
答:
通常情况下,CARD注释工作通过rgi工具来完成。然而,近期遇到了特定需求,需要自行构建流程进行CARD注释。下载CARD原始数据,分析card.json文件,其中包含
蛋白质
序列、层级注释和ID等信息。解析json文件,生成两个文件:ARO_level.tsv文件记录最底层ARO术语的注释;ARO_protein.
fasta
文件则包含ARO术语的序列信息...
生信中常用的文件格式认识(一)---
fasta
和fastQ
答:
fasta
格式形式如下图,由两部分组成。第一部分 :以大于号“ > ” 开头,接着是序列的标 识符“gi|187608668|ref|NM_001043364.2|”,然后是序列的描述信息。注意区分大小写,且不能出现空格,空格表示序列标识符结束;随后是序列的描述信息。所有来源于NCBI的序列都有一个gi号“gi|gi_identifier”...
fasta
格式最常见
的FASTA
格式
答:
数据库中存在冗余问题,即多个记录可能代表同一基因或
蛋白质的
变体。这可能导致分析结果偏差,例如,统计分析可能过度强调特定序列族。因此,非冗余数据的选择至关重要,需要在去除相似序列和保留信息之间
找到
平衡。此外,序列数据中还可能存在实验过程中的偏差或假象,如载体序列污染、异源序列污染、序列重排缺失...
小云教你用TransDecoder轻松预测
蛋白
开放阅读框序列
答:
小云带你轻松使用TransDecoder预测蛋白开放阅读框序列 如果你需要从转录本
的fasta
序列文件中
找出蛋白
序列和开放阅读框,TransDecoder是一个不错的选择。这款软件适用于Linux系统,安装过程简单,只需要从GitHub下载并执行命令即可。FASTA文件格式为标题后接序列,常见的命令如TransDecoder.LongOrfs用于识别至少100个...
存放核酸序列和氨基酸序列数据的标准文件是___。
答:
存放核酸序列和氨基酸序列数据的标准文件是
FASTA
格式文件和FASTQ格式文件。但具体来说,FASTA主要用于存放序列的基本信息,而FASTQ则包含了序列的质量信息。以下是对这两种格式的详细解释。FASTA格式:FASTA格式是一种简单的文本文件,用于表示核苷酸序列或
蛋白质
序列。这种格式的特点是,每个序列都由一个以">"...
请问:已经知道
FASTA
格式的氨基酸序列,
怎样找出
这段序列所表示的
蛋白
序...
答:
进入NCBI 数据库 将此氨基酸序列输入 query senquece 区域, 同时输入你要
找
的生物物种的名称(你的
蛋白
是人的?还是大肠杆菌的) 进行blast 便可。
HOW查鼠源
蛋白
基因CDS区
答:
让我们深入了解他的发现之旅。首先,
找到
人源
蛋白的
基因查询之路,堪称轻而易举。在Ensembl中,只需键入目标基因,选择人源+GO选项,你便会看到一个丰富的转录本列表,犹如一道迷人的风景线。点击后,无缝对接到NCBI,只需简单几步,CDS区
的FASTA
序列就能轻松解锁,宛如一场轻松的小游戏。然而,鼠源蛋白...
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