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简要介绍FASTA序列格式
列举常用的生物信息学数据库及
序列
对比常用软件及特点
答:
8、使用引物设计工具,针对下列未知
序列
设计一对引物,要求引物长度为20-25bp,扩增产物长度300-500bp,退火温度为50-60℃。请写出选择的一对引物(Forward Primer and Reverse Primer)、及相应的GC含量、引物的位点、Tm值和产物长度。一、步骤:进入google首页,搜索genefisher,进入主页,复制
fasta格式
,...
uniprot下载的文本文件
格式
是
答:
Uniprot下载的文本文件格式是
FASTA格式
。Uniprot提供的文本文件主要采用FASTA格式,这是一种用于表示生物
序列
信息的标准文本格式。FASTA格式包含了蛋白质和核酸序列的相关信息,包括序列的名称、描述以及具体的序列数据。这种格式的广泛应用使得用户能够方便地获取、解析和处理Uniprot数据库中的生物信息数据。对于生物...
SIFT :一个预测氨基酸替代是否影响蛋白功能的工具
答:
位置的序列数量在预测位置有一个氨基酸的序列数量。SIFT自动选择序列,但是如果这个替代位于蛋白序列首或尾,那么只有一些序列满足条件。这栏是预测这方面的。示例:预测单条蛋白序列 以单条蛋白序列为例,查看SIFT对序列的预测结果。步骤,1. 在如下图位置,粘贴
FASTA格式序列
一条蛋白序列。也可以上传...
做个程序从ncbi上的AccessionNum 获得
序列
信息?
答:
通过类似抓网页的方式来获得
序列
。eutils是NCBI的服务器,上面给出的是获取核苷酸序列的
fasta格式
文件,当然,它还有很多其他的功能。提醒你一点的是,发送连接每次不要超过500个id,两次链接之间要像个3秒钟。参考资料:http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/eutils_help.html ...
生物信息学,从GBK文件中提取核酸、蛋白
序列FASTA格式
文件?
答:
你写代码的地方不对 应该是先用其他任意编辑器写好py文件 然后python xx.py执行
急急急!请问测得了基因
序列
怎么进行同源性比对和构建进化树啊?谁可以帮...
答:
你可以把需要比对的
序列
用
fasta格式
保存在记事本里,然后用clustalW/clustalX的多重比对选项,直接按它默认的算法算算,生成的.dnd格式拿到MAGA里面的phylogeny——display newick tree from file选项中打开。就成了进化树了。可以在里面调整成你想要的表示方法和顺序,另存为就好了。还有就是用DNAMAN , ...
怎样将氨基酸存为
fasta格式
答:
在\“Enter accession number(s), gi(s), or
FASTA
sequence(s) \”输入你要查询的氨基酸
序列
,然后点击左下角的\“blast\”,搜索结果是好多个蛋白质的
genbank 中核苷酸
序列fasta格式
怎么下
答:
选sent后
fasta
一下就好了,其实也不用,你把
序列
复制在TXT里,然后再把文件名TXT改成想要的也行。
怎么从NCBI上查某个基因
序列
?
答:
3、
序列
选定 找到目标基因序列后,我们要将其下载下来。以给出第一个序列为例,点击序列前面的“小方格”,将其选定。4、下载序列 选定后,点击页面右上角的“Sendto”,选择“file”,再将format选择为“
FASTA
”
格式
,点击“Createfile”,将序列下载到自定的文件夹内。5、用DNAStar打开 下载的序列...
[实用教程]多
序列
比对工具MAFFT的使用教程
答:
安装WSL后,按照1.1节的步骤操作,只需稍作调整即可。直接下载ALL-in-one版本的zip包,解压至"D:\MAFFT",并将其路径添加到环境变量中。安装与启动 安装完毕后,可通过双击mafft.bat或在终端输入mafft来启动MAFFT主界面。主界面引导你完成关键步骤:输入输入文件路径,确保是标准的
FASTA格式
。指定输出...
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