11问答网
所有问题
当前搜索:
简要介绍FASTA序列格式
基因注释:基于SNAP+Augustus+GeneMark的maker3 pipeline
答:
中所述,“rmlib”选项应不填,“rm_gff”选项应该填写重复
序列
的gff文件 首先使用上一轮产生的比对结果进行训练 🔹maker2zff生成一个ZFF格式文件(genome.ann)和一个
FASTA格式
文件(genome.dna),过滤用于再次训练的高置信度基因,共有7个选项:-c 由EST/mRNA-Seq比对确定的剪接位点的比例...
taf是什么意思?
答:
TAFF
格式
不仅在生命科学领域得到广泛应用,还应用于其他领域,如计算机科学和工程学。TAFF文件的优势之一是其可读性,即使没有使用特定软件,用户也可以了解数据文件的内容。此外,TAFF格式还可以轻松转换为其他格式,例如
FASTA
和PDB,使其在其他生物信息学应用中具有更广泛的用途。相对于其他文件格式,TAFF有一...
懂mp4的来
答:
DNACompress 220K,免费的DNA
序列
压缩软件。原始网站。SeqnConverter 3.0 2.5M,将不同格式的序列文件转换成
FASTA格式
软件,2.1版增加GC的一些统计以便于一些用户进行基因组分析,DotPlot作图功能及图象的处理,包括对Dot图象的镜像、裁减、放大缩小几个功能,还增加了一个拼接作图的小功能。由作者郭骁才...
怎么用bioedit在基因组
序列
中找出已知序列的序列相似
答:
Bioedit提供了本地blast工具(菜单里的local blast 功能),如图一。你需要把基因组数据做成本地数据库,使用菜单里的create a local nucleotide database file功能建立本地DNA数据库,建库的原始数据需要做成
fasta格式
的,建成的数据库存放在...\bioedit\database文件夹里。然后用另一种菌的基因
序列
和...
信息工程在生物工程中的应用,具体点,300字左右…
答:
生物信息学在短短十几年间,已经形成了多个研究方向,以下
简要介绍
一些主要的研究重点. 1,
序列
比对(Sequence Alignment) 序列比对的基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性.从生物学的初衷来看,这一问题包含了以下几个意义:从相互重叠的序列片断中重构DNA的完整序列.在各种试验条件下从探测数据(probe...
...我这里有期末考试题,熟悉PDB数据库、蛋白质
序列
、mRNA
答:
1. 从PDB数据库中找一个3D结构已知的蛋白,查询取得其蛋白质
序列
、mRNA序列(仅包含ORF/CDS)和基因组序列(10分);2. 用Homologene或BlastP从蛋白质数据库中找15种以上与其高度同源的蛋白质序列,将序列下载并保存为一个
FASTA格式
的文件(10分);3. 找到每个蛋白相应的mRNA序列,截取从起始...
怎样通过AccessionNumber 怎样获得 RNA
序列
?
答:
用BioPerl我就会~~处理序列首选的语言就是Perl嘛 --- 以下这个例子可以利用 accesion number 获取一个蛋白质的
fasta格式序列
(或核苷酸序列)并将它输出到STDOUT:!/usr/bin/perl -w use strict;use Bio::DB::GenPept;use Bio::DB::GenBank;use Bio::SeqIO;my $db = new Bio::DB::GenPept(...
正常核苷酸
序列
如何转化
格式
啊?
答:
你把
序列
给我 我给你处理 QQ148256249
primer blast怎么用
答:
Primer-BLAST,在线设计用于聚合酶链反应(PCR)的特异性寡核苷酸引物。这个工具整合了目前流行的Primer3软件,再加上NCBI的 Blast进行引物特异性的验证。Primer-BLAST免除了用另一个站点或工具设计引物的步骤,设计好的引物程序直接用Blast进行引物特异性验证。
如何用Perl脚本将gff格式转换为
fasta格式
答:
如果目的是学习perl,对于没学习两种文件
格式
的人来讲一时半会看不懂两者之间的关系,以及如何变幻的,所以难以回答 最好碰到一个精通perl同时又是你这专业的人 才行
棣栭〉
<涓婁竴椤
8
9
10
11
13
14
15
16
17
涓嬩竴椤
12
灏鹃〉
其他人还搜