医院管理信息系统(Hospital Management Information System,HMIS)的主要目标是支持医院的行政管理与事务处理业务，减轻事务处理人员劳动强度，辅助医院管理，辅助高层领导决策，提高医院工作效率，从而使医院能够以少的投入获得更好的社会效益与经济效益，像财务管理系统、人事管理系统、住院病人管理系统、药品库存管理系统等均属于HMIS的范围。
临床信息系统(Clinical Information System,CIS)的主要目标是支持医院医护人员的临床活动，收集和处理病人的临床医疗信息，丰富和积累临床医学知识，并提供临床咨询、辅助诊疗、辅助临床决策，提高医护人员工作效率和诊疗质量，为病人提供更多、更快、更好的服务，像医嘱处理系统、病人床边系统、重症监护系统、移动输液系统、合理用药监测系统、医生工作站系统、实验室检验信息系统、药物咨询系统等均属于CIS范围。
医院信息系统应具备以下基本功能：
（1）收集并永久存储医院所需全部数据。
（2）由于医院信息尤其是病人信息具有动态数据结构和数据快速增加的特性，医院信息系统应具有大容量的存储功能。
（3）数据共享。
（4）要能快速、准确地随时提供医院工作所需要的各种数据，支持医院运行中的各项基本活动。
（5）具有单项事务处理、综合事务处理和辅助决策功能。
（6）具备数据管理和数据通信的有效功能，确保数据的准确、可靠、保密、安全。
（7）为了保证医疗活动和医院动作不间断地运转，系统应具备持续运行的功能。
（8）具有切实有效的安全、维护措施，确保系统的安全性。
（9）具备支持系统开发和研究工作的必要软件和数据库。
（10）具有良好的用户环境，终端用户的应用和操作应简单、方便、易学、易懂。
（11）系统具有可扩展性
医院信息系统的作用是
1.提高医院的运行管理效率
2.使医院的各种资源进行合理利用
3.促进医院的快速发展
4.提高医院经济效益和社会效益，让医院能够以少的投入获得更好的社会效益与经济效益。
