公司在年底集中安排职工休年休假合法。
根据《国务院职工带薪年休假条例》第五条规定，用人单位根据生产经营工作情况，考虑职工意愿，统筹安排职工年休假，可以几种安排，也可以分散安排。用人单位对年休假的具体休假时间，有安排权，公司根据生产经营工作需要，在年底集中安排职工休年休假符合法律规定。
国务院
《职工带薪年休假条例》
第五条 单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。
年休假在1个年度内可以集中安排，也可以分段安排，一般不跨年度安排。单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。
单位确因工作需要不能安排职工休年休假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年休假。对职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。
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