别着急，没什么关系的。
1、三方协议是由教育部统一印制的，全称是：《全国普通高等学校毕业生就业协议书》。三方分别是：毕业生、用人单位、学校。这份协议不是合同，更像是一份就业意向书，自三方签子盖章之后生效，至毕业生到用人单位报到为止。当然你也可以与用人单位协商解除这份协议，但愿你没约定什么违约金，否则需要支付一部分违约金。
2、报到证，上下两联。学校会在6月上旬和中旬收集毕业生的三方协议，将涉及的用人单位名称、学生个人信息上报属地教委后制成《全国普通高等学校本专科毕业生就业报到证》或《全国毕业生研究生报到证》，加盖教委的毕业生调配专用章之后，一联存在档案里，一联毕业的时候交给学生，档案发给单位或者人才，学生拿着去找单位或者人才，单位或者人才收下和档案里面的一对比，吻合就OK。有点像接头信物、介绍信之类的。
首先你要和学校讲清楚你毕业之后不就业了要继续上学，请学校不要把档案发给单位或者人才（要是已经发给单位了三方协议解除更麻烦），入学通知书到手了没有，到手的高给学校看看原件交个复印件，或者是按学校的规定该交啥交啥，并要求不要把存档那一联存到档案里，这样档案就会发到你准备上学的学校。你自己手上那份学校不收回的话，自己留着做个纪念吧。
PS:不知道是不是有些影响这件事的重要的具体情况你没讲，不妨去问问导员、就业中心工作人员这样你可能会更放心。
追问那是不是说如果不解除三方协议，我的档案就必须跟着报到证走。我的就业协议还比较特殊，不是直接录用我的协议书，还必须参加一个特岗考试，考过以后面试过了才算真正的录用。
追答是这样啊，三方协议啊，你白纸黑字签字画押了，虽然不是卖身契，但是还是要尊重他的效力。既然钱的时候是三方，其他两方没变化，你这一方有变化就有义务与其他两方沟通协调去解除，我相信说清楚学校不会为难自己学生，用人单位也不会要一个身在曹营心在汉的员工，大不了直接说什么特岗考试直接弃考，面试肯定不去嘛。
档案发到哪里关键在学校，你的档案在学校手里，往哪里发决定权在学校，要是近期学校管学生档案的就要开始寄发档案了，一定要做好学校工作，证明你确实被录取了，三方协议正在解除，让他们把档案发到你读研的学校去。