你需要使用/fill命令，并使用replace参数。
语法为：/fill <x1> <y1> <z1> <x2> <y2> <z2> <用于替换的方块名称> <用于替换的方块数据> replace [被替换方块名] [被替换方块数据]
解释：<x1> <y1> <z1>和<x2> <y2> <z2>是这片区域的两个对角方块的坐标。你可以使用绝对坐标（如12 66 73），也可以使用相对坐标（用“~”来确定）；<用于替换的方块数据>和[被替换方块数据]是用来修饰方块的数据，鉴于问题比较简单可以不填；<用于替换的方块名称>和[被替换方块名]必须是方块ID，例如minecraft:oak_leaves（或者在Java版1.12.2以前是数字，请查找自己版本的方块ID）。上述参数输入的时候不需要带上“<>”或是“[]”。
举个栗子：
/fill 12 66 73 12 76 83 minecraft:air replace minecraft:oak_leaves 可以将这片区域内的橡树树叶替换成空气。
/fill ~-3 ~-3 ~-3 ~3 ~-1 ~3 minecraft:air replace minecraft:oak_log 可以将玩家脚下为顶面中心7x3x3的区域中的橡树树干替换成空气。
你可以根据这两个例子修改自己的命令。
Java版1.13开始使用的树干的方块ID有
橡木原木 minecraft:oak_log
云杉原木 minecraft:spruce_log
白桦原木 minecraft:birch_log
丛林原木 minecraft:jungle_log
金合欢原木 minecraft:acacia_log
深色橡木原木 minecraft:dark_oak_log
树叶的方块ID有
橡树树叶 minecraft:oak_leaves
云杉树叶 minecraft:spruce_leaves
白桦树叶 minecraft:birch_leaves
丛林树叶 minecraft:jungle_leaves
金合欢树叶 minecraft:acacia_leaves
深色橡树树叶 minecraft:dark_oak_leaves
fill指令还有许多其他用法，如果有兴趣了解可以到Minecraft Wiki上查看。