1、区别在于，一个是本科，一个是专科，虽然有些三本的分数不见得比好的专科分数高，学生素质也不见得好，但是比如在就业和公务员报考中，大多数单位都要求本科及以上学历，那样三本就有资格而专科就不行。包括考研，三本可以和其他本科生一样报考，而专科只能毕业满两年，不得跨专业报考，复试加试等很多苛刻条件。
2、三本院校很多都是挂靠在某大学下的独立学院，是这些大学的重要资金来源之一，而且像普通的二本省属院校和一本部属院校，国家和各省在财政上会有很多的支持，学校的经费较三本比较宽裕，而三本院校获得的财政支持很少，为了维持学校的正常运转，这笔钱只能从学生中收取了。
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考