霉菌营养菌丝的特化结构：
假根（rhizoid）：根霉属（Rhizopus）等低等真菌的匍匐菌丝与固体基质接触处分化出来的根状结构，具有固着和吸收营养等功能。
匍匐菌丝（stolon）：又称匍匐枝。毛霉目（Mucorales）真菌在固体基质上常形成与表面平行，具有延伸功能的菌丝。
吸器（haustorium）：某些专性寄生性真菌侵入寄主后，菌丝在寄主细胞间隙蔓延，并侧生出短枝侵入细胞内形成指状、球状或丝状的构造，用以吸收细胞内的养料。
附着胞（adhesivecell）：许多植物寄生菌在其芽管或老菌丝顶端发生膨大，并分泌出粘状物，借以牢固地粘附到宿主表面的结构。
附着枝（adhesivebranch）：某些寄生真菌由菌丝细胞生出1～2个细胞的短枝，将菌丝附着于宿主体上的结构。
菌核（sclerotium）：由菌丝集聚并分化成的形状、大小不一的团块状结构，是一种休眠的菌丝组织。
菌索(rhizomorph,funiculus)：由大量菌丝平行聚集成的白色根状组织，具有促进菌体蔓延和抵御不良环境的功能。
菌丝陷阱（hyphaltrap）——菌环（ring）和菌网（net）：一些具有捕食能力的真菌菌丝分化成的环状或网状的菌丝特化结构，用以捕捉线虫等微小动物。
（1）酵母型菌落：外观上与细菌的菌落相似，菌落湿润，柔软而致密。如酵母菌、隐球菌的菌落。
（2）类酵母型菌落：有部分单细胞真菌能形成假菌丝，由菌落向下生长，伸入培养基，这种菌落称类酵母菌落，如念珠菌。
（3）丝状型菌落：是多细胞真菌的菌落形式，由许多疏松的菌丝体构成。丝状菌落的形态、结构与颜色常作为鉴定真菌的参考。真菌容易发生变异。在培养基上人工传代或培养时间过久，其形态、培养特性甚至毒力都可发生改变。