林权证无效的情形主要有：
1、林地被依法征用、占用，并办理了注销登记手续的；
2、由于其他原因导致林地发生灭失的，权利人办理了注销登记；
3、原来的林权证遗失、损坏，以及不办理应当林权证，原林权证因此作废无效。
林权权利人为个人的，由本人或者其法定代理人、委托的代理人提出林权登记申请，林权权利人为法人或者其他组织的，由其法定代表人、负责人或者委托的代理人提出林权登记申请。
《林木和林地权属登记管理办法》
第七条
林地被依法征用、占用或者由于其他原因造成林地灭失的，原林权权利人应当到初始登记机关申请办理注销登记。第八条
林权权利人申请办理变更登记或者注销登记时，应当提交下列文件：
（一）林权登记申请表；
（二）林权证；
（三）林权依法变更或者灭失的有关证明文件。