申论A卷和B卷虽然同是申论，但是两者还是有很多差别的，主要区别在于能力考察的区别和题型题量的区别。
考查内容不同。A卷要求考查“综合分析能力”与“提出和解决问题能力”;而B卷只要求考查“解决问题能力”与“贯彻执行能力”。考试难度不同。一般来说，“综合分析”、“提出问题”方面的考题，要比“解决问题”或“贯彻执行”方面的考题难度大。由此说明：A卷肯定比B卷的难度大。
报考岗位不同。A卷报考的是综合管理类岗位，B卷报考的是行政执法类岗位。基本上属于两个层次的考试。
因为能力的要求不同，所以对应的考试题目考察的能力也不太相同。比如说A卷考察的内容包括阅读理解、综合分析、提出和解决对策及文字表达能力，但是B卷主要考察包括阅读理解、贯彻执行、群众工作和应用写作方面的能力。其次，申论考试和考研的英语一和英语二差不多，有题型题量的区别。
详细不同：
A卷的大纲要求考生能够“多角度地思考资料内容，作出合理的推断或评价”及“简明畅达地表述思想观点”等，说明A卷的材料及考题重在考查：考生对理论材料进行分析和判断的能力，理论性材料一般应该比事例材料多。
B卷的大纲则要求考生能够“对事件、观点进行准确合理的说明、陈述或阐释”等，表明B卷的材料及考题重在考查：考生对事例材料进行陈述和分析的能力，事例材料应该是主导的。
A卷的大纲要求“准确提炼事实所包含的观点，并揭示所反映的本质问题。”其中，“提炼”与“揭示”这两个词表明，考生需要把材料中的具体思想观点概括抽象出来，并不是简单地归纳材料。这就要求考生对问题要有自己的判断，而不是人云亦云，更不能一切都依赖材料，要有自己独到的分析与见解。
B卷的大纲要求“对给定资料所涉及的观点、事实作出恰当的解释。”其中，“恰当的解释”表明，只需考生能够正确理解或解释所给材料的主要内容，即可，很明显要比A卷容易些。