1957年被卫生部指定为全国心胸外科进修基地，1988年起成为上海第二医科大学教学医院，2004年成为上海市红十字胸科医院，2005年成为上海交通大学附属医院。医院曾先后获“上海市职业道德建设十佳单位”、“市卫生系统文明单位”、“市文明单位”等项殊荣。
医院技术力量雄厚,设有心内、心外、肺内、胸外、中西医结合、急诊、放疗、麻醉及重症监护等10个临床科室和放射、病理、核医学、超声诊断等13个医技科室；核定床位580张，有病区16个，包括2个特需病区、1个干部病区,另设ICU和CCU。还附设上海市胸部肿瘤研究所。
医院现有职工1000余名，其中正副主任医师105名、正副教授50余名、博士生导师、硕士生导师21名、享受国务院特殊津贴26名，并有10名分别进入上海市卫生系统“医苑新星” 、“跨世纪学科带头人培养计划”和“上海市优秀中青年医学人才培养计划”。医院医疗设备先进，拥有DSA、多排螺旋CT、ECT、直线加速器、模拟定位机、三维治疗计划系统、多叶准直器、彩色多普勒心动超声仪、全自动生化分析仪及ICU、CCU监护系统等先进医用设备。
医院面向全国,每年收治的门急诊和住院病人逾14万人次,建院以来已施行各类胸部手术逾8万例，心脏介入逾6000例，成功地医治和抢救了数以万计的疑难重危病人；医院开展的心脏、肺、胸骨移植术、“冠心搭桥术”，心脏单、双瓣膜置换术，各种心脏复杂畸形的诊断和纠治，各类肺、食管、气管、纵隔手术,各类心脏疾病的介入诊断治疗,顽固性心衰、恶性心律失常和大面积急性心肌梗塞的救治,气管镜的诊疗技术以及病理细胞、组织学检测等均居国内先进水平；肺癌的早期发现和综合治疗、气管术式的创新等居国际先进水平。
医院注重专科领域的基础、应用和开发课题的研究，建院以来获国家级、部级、市级等科研项目61项，科研奖项43项；申请各类专利33项；在完成上海市首批医学领先专业“胸心外科学”与“肺部肿瘤学”两个周期建设的基础上，目前医院正承担着上海市肺部肿瘤学临床医学中心及上海市医学重点学科“胸外科”的建设；并承担着多项国家、部、市、局级课题的研究。
