林场站：05：50-23：00。
秣周东路站：06：00-23：10。
线路走向：
南京地铁3号线自京沪铁路林场站，沿原规划京沪高速铁路北线方案南行，上跨宁合公路后，于泰冯路站与地铁S8号线交叉换乘。线路南下穿长江到上元门后，沿中央北路布置，至南京火车站与地铁1、6号线换乘。
过南京站后线路南拐，先后下穿沪宁城际铁路、京沪普铁、新庄立交桥、玄武湖，过北京东路后，沿太平北路、太平南路南行；穿夫子庙后沿江宁路、土城头路布设，穿过卡子门立交桥后，线路沿宁溧公路南行，于丁墙路以南，欧倍得超市与麦德隆商场间向西转，垂直穿过京沪高速铁路。
并结合高速铁路客站设本线南京南站，之后线路进入江宁区利源北路、利源中路和苏源大道南行，在九龙湖广场向东折行，沿清水亭西路布设，过九龙湖站后向南折行，沿双龙大道布设，至双龙大道与秣周东路交叉路口设终点站。
南京地铁3号线三期工程北起秣周东路站（已建），沿双龙大道向南，下穿云台山河后继续沿路向南至正方大道，设和风路站和秣陵街道站。